25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3310 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3310  SMC domain protein  100 
 
 		 433 aa  870    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0981  hypothetical protein  28.1 
 
 		 419 aa  133  6.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000423266  decreased coverage  3.25567e-17 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  24.05 
 
 		 1061 aa  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  24.83 
 
 		 581 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  40.62 
 
 		 1196 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0004  DNA replication and repair protein RecF  38.6 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1763  SMC domain-containing protein  29.37 
 
 		 880 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0913667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0003  recombination protein F  33.33 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00186248  hitchhiker  0.000000180359 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  40.62 
 
 		 1196 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  40.62 
 
 		 1196 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  33.75 
 
 		 1021 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  29.75 
 
 		 403 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  36.67 
 
 		 1194 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0003  recombination protein F  30 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  40.91 
 
 		 680 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  30.3 
 
 		 1082 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  35 
 
 		 1207 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0944  SMC protein-like protein  31.96 
 
 		 483 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.665094  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0003  DNA replication and repair protein RecF  38.46 
 
 		 360 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0698954  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0003  DNA repair and genetic recombination protein  35.19 
 
 		 365 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  38.03 
 
 		 789 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  25.79 
 
 		 1146 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.77 
 
 		 1147 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 804 aa  43.1  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0003  DNA replication and repair protein RecF  32.14 
 
 		 363 aa  43.1  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0752559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>