78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0023 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0023  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0249059  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0029  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0012  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000162811  hitchhiker  0.00834179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000289673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0017  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0021  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0163136  normal  0.708975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0059  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0038  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0320  tRNA-Trp  100 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000012562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0052  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1869  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000841204  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0050  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0051  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0009  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000520424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0015  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00419833  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0012  tRNA-Thr  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0011  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000312741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0032  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.386226  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0007  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0025  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000025626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0042  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0017  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0012  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 83 bp  46.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  8.82473e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_326  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00688078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0056  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0002  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000179281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0042  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0276832  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0020  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0007  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000187685  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0040  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.560238 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0047  tRNA-Thr  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0022  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0042  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158394  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0025  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA25  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0018  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.46927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>