297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0021 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  96 
 
 		 76 bp  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  94.67 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  94.52 
 
 		 73 bp  113  6e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0021  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0163136  normal  0.708975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0021  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0223397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  93.15 
 
 		 73 bp  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  91.78 
 
 		 73 bp  97.6  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0037  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0027  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0034  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  90.41 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24920  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.952959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24910  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0034  tRNA-Lys  95.92 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0014  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0062  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0061  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19940  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.53121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  97.44 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0015  tRNA-Lys  88.73 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0063  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.538601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0011  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.998721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0007  tRNA-Trp  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0030  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186528  normal  0.069463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0020  tRNA-Lys  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.482311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0025  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>