98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_R0034 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  97.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0021  tRNA-Lys  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0163136  normal  0.708975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  97.96 
 
 		 76 bp  89.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  97.73 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0061  tRNA-Lys  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  95.74 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0062  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  95.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0063  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.538601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24920  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.952959 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  92 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0021  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0223397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24910  tRNA-Lys  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  97.22 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0015  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.42027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0014  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0034  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0036  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0037  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205438  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0027  tRNA-Lys  89.36 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19940  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.53121  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0056  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0020  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.482311  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5549  GCN5-related N-acetyltransferase  96.43 
 
 		 654 bp  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0053  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0014  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289173  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0025  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0030  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186528  normal  0.069463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0028  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572001  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08480  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0822339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0025  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3233  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0015  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0103939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0809  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.269889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0004  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000188757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0968  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0639  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2668  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2409  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0805  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0003  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0022  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04914  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42096  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0051  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106867  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0025  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0688964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0048  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758644  normal  0.700534 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0002  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584734  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>