248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_R0014 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_R0014  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289173  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0003  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237532  decreased coverage  0.00216648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0006  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0022  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.622562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06610  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.506381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0032  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000101474  normal  0.0845198 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06600  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.513034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13130  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0983321  normal  0.642579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0046  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000652879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0031  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2872  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0031  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0031  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000643005  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2868  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000077985  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2866  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000326187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0028  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.546995  normal  0.0230083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04914  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.42096  normal  0.919777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.269889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0009  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0004  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000188757  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0002  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.584734  normal  0.701084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0968  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228229  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0025  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0688964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0639  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0015  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0103939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0003  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2668  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.347183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0022  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2409  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0805  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0809  tRNA-Met  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0048  tRNA-Met  88.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758644  normal  0.700534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00034  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.107605  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00035  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0182063  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0039  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000583297  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0040  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000809411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0042  tRNA-Asn  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0486048  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04000  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000234259  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_003295  RS04831  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000000733307  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0008  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0036  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0039  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000683779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0067  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1694  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1695  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000039183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0048  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.780393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0058  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000161243  normal  0.35432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0041  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.0000000000000766368  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0045  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000363633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0017  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000497879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0018  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000000318687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0014  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0033  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000348439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0034  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.000000000129233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0049  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2777  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000132175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2778  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.00000000000000136224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2815  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000000687096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2816  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000213443  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2876  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00000608308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>