14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_R0049 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0003  tRNA-Lys  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237532  decreased coverage  0.00216648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0006  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0014  tRNA-Lys  90.54 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289173  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0022  tRNA-Lys  88.06 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.622562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0048  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.048263  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0041  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.495782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0025  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.146097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0037  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.279922 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0041  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.750372  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0041  tRNA-Met  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>