79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0006 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0006  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0003  tRNA-Lys  95.95 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237532  decreased coverage  0.00216648 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0049  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.276362 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0022  tRNA-Lys  96.08 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.622562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0014  tRNA-Lys  89.86 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.289173  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0024  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0048  tRNA-Lys  89.19 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.048263  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  87.84 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0025  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0028  tRNA-Asn  92.31 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0001  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0132  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0291  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0104  tRNA-Lys  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0006  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0040  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00746142 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0018  tRNA-His  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00677914  normal  0.417435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna118  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000544354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0072  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna098  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna093  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000268933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0073  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0074  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0071  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0421157  hitchhiker  0.003467 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0076  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41661  normal  0.163514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0033  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.140057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0034  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139081 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0076  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373863  normal  0.566101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0020  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0002  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.099087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0010  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00296143  hitchhiker  0.00854354 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0013  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00193967  normal  0.0198521 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0020  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0010  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03600  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04002  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000208325  normal  0.100759 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0008  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.40155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0012  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0061328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0013  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0641793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0338  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0083  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456541  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0120  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0008  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0029  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.25599  normal  0.694984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0017  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143613  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0017  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000270775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0018  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000139962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0050  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00633493  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0073  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.576385  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02962  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0023  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104311  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2342  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0148  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0140  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2266  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0040  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0014  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000717707 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2817  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0031  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0028  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000473663  hitchhiker  0.000687264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0076  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000822229  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>