80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0012 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0012  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108996  unclonable  0.0000000137138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0034  tRNA-Arg  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.904479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0033  tRNA-Arg  90.77 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0040  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0006  tRNA-Arg  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0037  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0004  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0099  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.108565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0017  tRNA-Arg  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121819  normal  0.240966 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  87.27 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0003  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.972856  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0082  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0011  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0234667  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0027  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.360005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2557  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.55794e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0042  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0118555  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000167821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0024  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000092316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0001  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000193558  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0042  tRNA-Arg  90 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1468  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19370  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0034  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0058  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0014  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.951342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2040  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000158642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000884624  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.581803  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.269516  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1761  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0052  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.179946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0050  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000306813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0041  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.225323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09780  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0646814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0060  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0019  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000464578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0019  tRNA-Arg  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.732276  normal  0.397145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_R0070  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0238659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0004  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0049  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.589748  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0030  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0003  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>