66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0111 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  100 
 
 
462 aa  948    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  61.12 
 
 
465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  61.21 
 
 
465 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  56.14 
 
 
453 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  44.47 
 
 
475 aa  363  3e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  40.39 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  24.88 
 
 
444 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  25.14 
 
 
454 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  27.05 
 
 
453 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  24.79 
 
 
457 aa  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  28.49 
 
 
450 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  30.74 
 
 
455 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  24.6 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  26.92 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  26.23 
 
 
539 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  23.86 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  28.19 
 
 
439 aa  65.1  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3971  hypothetical protein  27.02 
 
 
463 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0844956  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  23.68 
 
 
469 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  26.16 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  29.07 
 
 
451 aa  60.5  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  26.12 
 
 
446 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  28.08 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  25.68 
 
 
557 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  23.99 
 
 
440 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  23.8 
 
 
475 aa  58.2  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  23.22 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  30.48 
 
 
455 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  24.61 
 
 
526 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  23.15 
 
 
545 aa  57  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  22.99 
 
 
469 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5101  protein of unknown function DUF404  23.87 
 
 
489 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  24.38 
 
 
583 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  21.8 
 
 
487 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  21.45 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  26.74 
 
 
518 aa  54.7  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1427  hypothetical protein  21.13 
 
 
470 aa  53.1  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  24.65 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  23.01 
 
 
472 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1032  hypothetical protein  22.32 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.475477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  25.57 
 
 
490 aa  52.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3586  hypothetical protein  24.93 
 
 
446 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000666104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1086  hypothetical protein  23.74 
 
 
429 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1590  hypothetical protein  31.21 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  22.65 
 
 
469 aa  51.2  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  20.67 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  23.95 
 
 
520 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1117  hypothetical protein  29.05 
 
 
477 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  27.73 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0673  hypothetical protein  28.85 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2400  hypothetical protein  28.85 
 
 
409 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1195  hypothetical protein  28.85 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0792  hypothetical protein  28.85 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1756  hypothetical protein  28.85 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  27.63 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  21.41 
 
 
479 aa  47  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1047  hypothetical protein  23.51 
 
 
491 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100959  normal  0.237533 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2474  hypothetical protein  24.63 
 
 
515 aa  46.6  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.813576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0647  protein of unknown function DUF404  19.95 
 
 
482 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2050  protein of unknown function DUF404  23.41 
 
 
497 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  21.62 
 
 
479 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0879  hypothetical protein  25.31 
 
 
424 aa  43.9  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.379593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  26.37 
 
 
865 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3276  hypothetical protein  23.94 
 
 
476 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0241906  normal  0.380313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1213  protein of unknown function DUF404  22.87 
 
 
553 aa  43.5  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  26.24 
 
 
456 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>