18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1453 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  80.84 
 
 		 475 aa  790    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  960    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  44.26 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  43.16 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  38.34 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  40.39 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  24 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  22.02 
 
 		 454 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  21.96 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  26.54 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  21.25 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  30.47 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3971  hypothetical protein  26.04 
 
 		 463 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0844956  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  28.06 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  29.39 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  26.67 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  29.55 
 
 		 446 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  26.82 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>