44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2154 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  80.84 
 
 		 474 aa  790    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  100 
 
 		 475 aa  967    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  46.57 
 
 		 465 aa  378  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  43.57 
 
 		 453 aa  375  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  46.24 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  44.47 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  27.16 
 
 		 444 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  23.12 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  22.55 
 
 		 457 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  28.31 
 
 		 450 aa  77.4  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  29.54 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3971  hypothetical protein  29.68 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0844956  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  30.11 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  30.11 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  26.37 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  26.32 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  28.24 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  26.32 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  26.32 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  26.32 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  20.23 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  26.32 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  26.32 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  26.32 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  26.32 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  25.68 
 
 		 865 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  24.05 
 
 		 545 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  26.22 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  32.8 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2597  hypothetical protein  23.28 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.016165  normal  0.695795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  30.34 
 
 		 455 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  22.88 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  23.76 
 
 		 539 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  23.28 
 
 		 518 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  22.1 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  25.22 
 
 		 861 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  25.43 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  25.36 
 
 		 551 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  20.89 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  27.25 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  28.65 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  39.78 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2948  hypothetical protein  26.09 
 
 		 844 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.139026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1869  hypothetical protein  22.01 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.242518  normal  0.620007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>