77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1801 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  942    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  85.38 
 
 		 465 aa  807    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  61.12 
 
 		 462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  55.51 
 
 		 453 aa  512  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  46.24 
 
 		 475 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  43.16 
 
 		 474 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  26.45 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  25.07 
 
 		 457 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  23.08 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  22.82 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  28.44 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  27.69 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  26.32 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  24.37 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  25.23 
 
 		 462 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  26.21 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  28.24 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5719  protein of unknown function DUF404  25.86 
 
 		 539 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  27.47 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  29.41 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1086  hypothetical protein  26.49 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  23.96 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  26.58 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  26.11 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  26.03 
 
 		 557 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  23.49 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  25.62 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  30.83 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  23.67 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  24.25 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2098  hypothetical protein  27.19 
 
 		 526 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37690  hypothetical protein  24.58 
 
 		 469 aa  54.3  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  23.9 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  24.54 
 
 		 472 aa  53.9  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  25.68 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2292  hypothetical protein  25.27 
 
 		 865 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  27.19 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  23.43 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4571  protein of unknown function DUF404  24.46 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.903579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  23.43 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17370  hypothetical protein  26.64 
 
 		 552 aa  51.6  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0800507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  24.49 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  23.6 
 
 		 583 aa  51.6  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  25.94 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  24.83 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  26.74 
 
 		 518 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  22.22 
 
 		 471 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3586  hypothetical protein  23.85 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000666104 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  23.2 
 
 		 479 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3971  hypothetical protein  26.67 
 
 		 463 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0844956  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  25.13 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1401  hypothetical protein  23.96 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.254392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  23.53 
 
 		 471 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  25.66 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  22.6 
 
 		 479 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  26.29 
 
 		 520 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  23.36 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3415  hypothetical protein  22.9 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  23.16 
 
 		 482 aa  47  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3761  hypothetical protein  23.97 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.0284704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  24.57 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2264  hypothetical protein  24.24 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  21.38 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42160  hypothetical protein  24.79 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1590  hypothetical protein  35.96 
 
 		 409 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0673  hypothetical protein  32.31 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2400  hypothetical protein  32.31 
 
 		 409 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.286069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1195  hypothetical protein  32.31 
 
 		 460 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.276342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  24.41 
 
 		 567 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1756  hypothetical protein  31.54 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1117  hypothetical protein  31.54 
 
 		 477 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  24.41 
 
 		 567 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  24.41 
 
 		 567 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0792  hypothetical protein  31.54 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40428  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  22.84 
 
 		 487 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  25.16 
 
 		 551 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  24.89 
 
 		 503 aa  43.1  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>