23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2308 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  100 
 
 
424 aa  858    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  50.97 
 
 
429 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  53.28 
 
 
439 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  50.71 
 
 
455 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  50.72 
 
 
440 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  51.44 
 
 
451 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  48.83 
 
 
557 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  50.96 
 
 
583 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  51.44 
 
 
377 aa  345  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  38.86 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  36.68 
 
 
381 aa  226  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  26.89 
 
 
405 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  33.17 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  29.93 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  28.24 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  28.24 
 
 
475 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  28.08 
 
 
462 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  26.82 
 
 
454 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  24.57 
 
 
444 aa  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  23.4 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3475  hypothetical protein  28.62 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  26.78 
 
 
457 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  26.8 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>