18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4493 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4493  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1142    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2842  hypothetical protein  77.5 
 
 		 440 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2702  hypothetical protein  59.73 
 
 		 583 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3651  hypothetical protein  50.57 
 
 		 455 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2728  hypothetical protein  55.37 
 
 		 439 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283161  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2308  hypothetical protein  49.3 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1781  hypothetical protein  51.04 
 
 		 377 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.44232 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2217  hypothetical protein  50.48 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0717  hypothetical protein  43.93 
 
 		 429 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3263  hypothetical protein  37.8 
 
 		 381 aa  226  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.521841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3032  hypothetical protein  37.3 
 
 		 373 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31543e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2693  hypothetical protein  26.42 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.658833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  25.17 
 
 		 453 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  19.8 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  24.2 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  23.53 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  24.31 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  24.8 
 
 		 457 aa  47.8  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>