13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0461 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  907    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  28.49 
 
 		 462 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  28.44 
 
 		 465 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  27 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  25.65 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2154  hypothetical protein  28.31 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.480414  hitchhiker  0.00287082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  26.23 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1453  hypothetical protein  26.54 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  33.57 
 
 		 455 aa  66.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  20.99 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  23.39 
 
 		 454 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  29.81 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  26.53 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>