17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2485 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2668  hypothetical protein  87.89 
 
 		 456 aa  804    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.519412  decreased coverage  0.0000451664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2485  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  900    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0461  hypothetical protein  25.37 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4830  hypothetical protein  23.9 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2616  hypothetical protein  28.5 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.920339  normal  0.35815 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1305  hypothetical protein  30.18 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.364108  normal  0.63665 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09860  hypothetical protein  25.44 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726307  normal  0.031392 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4992  hypothetical protein  25.89 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1801  hypothetical protein  27.19 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2104  hypothetical protein  21.21 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0111  protein of unknown function DUF407  27.73 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500585  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08410  hypothetical protein  21.24 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3559  hypothetical protein  28.49 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.901378  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08440  hypothetical protein  26.14 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.696595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  27.22 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3627  hypothetical protein  28.49 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.839093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4990  hypothetical protein  27.13 
 
 		 462 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>