238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0879 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0879  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  861    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.379593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2471  protein of unknown function DUF404  34.12 
 
 		 472 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5273  hypothetical protein  33.89 
 
 		 472 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3157  hypothetical protein  34.12 
 
 		 472 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.167817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2415  hypothetical protein  33.42 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3519  hypothetical protein  33.89 
 
 		 476 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1078  hypothetical protein  33.42 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2301  protein of unknown function DUF404  36.39 
 
 		 503 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2240  hypothetical protein  34.6 
 
 		 489 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.530093  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3216  hypothetical protein  34.12 
 
 		 472 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1936  hypothetical protein  34.31 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.881326  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2901  protein of unknown function DUF404  32.3 
 
 		 469 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00642999  normal  0.711404 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4002  hypothetical protein  33.65 
 
 		 471 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.247341  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0391  hypothetical protein  33.09 
 
 		 473 aa  202  9e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3524  hypothetical protein  33.9 
 
 		 470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3437  hypothetical protein  32.78 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3415  hypothetical protein  34.07 
 
 		 471 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4258  hypothetical protein  34.07 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.407533  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4108  hypothetical protein  34.07 
 
 		 476 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3166  protein of unknown function DUF404  31.83 
 
 		 469 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.839276  normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2114  hypothetical protein  32.04 
 
 		 486 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.392163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1815  hypothetical protein  33.25 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.02256  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3101  hypothetical protein  34.44 
 
 		 481 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0773  hypothetical protein  33.58 
 
 		 478 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1066  hypothetical protein  33.58 
 
 		 478 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0765  hypothetical protein  33.58 
 
 		 478 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2041  hypothetical protein  33.58 
 
 		 477 aa  199  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0674  hypothetical protein  33.58 
 
 		 477 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1781  hypothetical protein  33.58 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2052  hypothetical protein  33.58 
 
 		 471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1922  u1937b; B1937_F1_4  33.58 
 
 		 471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1676  protein of unknown function DUF404  31.94 
 
 		 482 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0006  hypothetical protein  32.7 
 
 		 470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.377329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3052  hypothetical protein  34.86 
 
 		 482 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6763  hypothetical protein  34.6 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.087033  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3540  hypothetical protein  33.25 
 
 		 471 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0990  hypothetical protein  33.93 
 
 		 484 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2676  hypothetical protein  31.83 
 
 		 475 aa  196  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10129  normal  0.508929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5079  hypothetical protein  33.25 
 
 		 489 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.921334  normal  0.0721904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2164  protein of unknown function DUF404  33.41 
 
 		 479 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7510  protein of unknown function DUF404  34.36 
 
 		 479 aa  196  7e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.260838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4106  hypothetical protein  33.66 
 
 		 471 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0519  hypothetical protein  30.55 
 
 		 481 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3242  protein of unknown function DUF404  32.47 
 
 		 475 aa  195  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.657698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2775  hypothetical protein  33.25 
 
 		 477 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3320  hypothetical protein  33.41 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2208  hypothetical protein  33.57 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.180317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2484  protein of unknown function DUF404  33.57 
 
 		 479 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.94163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3390  hypothetical protein  31.67 
 
 		 471 aa  193  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0584  hypothetical protein  33.65 
 
 		 479 aa  193  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4482  hypothetical protein  31.83 
 
 		 469 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0404  hypothetical protein  32.6 
 
 		 485 aa  192  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2522  protein of unknown function DUF404  32.7 
 
 		 487 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2905  hypothetical protein  32.7 
 
 		 487 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3403  protein of unknown function DUF404  32.85 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2607  hypothetical protein  33.5 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.673052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2131  hypothetical protein  34.13 
 
 		 520 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0038643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2056  hypothetical protein  32.07 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1012  protein of unknown function DUF404  33.49 
 
 		 482 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0541998  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1183  hypothetical protein  33.26 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1353  hypothetical protein  32.52 
 
 		 518 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260434  normal  0.0247151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2245  protein of unknown function DUF404  33.57 
 
 		 490 aa  190  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.500503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4443  protein of unknown function DUF404  32.3 
 
 		 469 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0540  hypothetical protein  33.09 
 
 		 492 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.916398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3035  hypothetical protein  32.23 
 
 		 486 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4511  hypothetical protein  31.83 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.739252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3876  protein of unknown function DUF404  32.1 
 
 		 476 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2666  hypothetical protein  31.75 
 
 		 544 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192655  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3462  hypothetical protein  31.28 
 
 		 488 aa  188  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0178191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1567  hypothetical protein  31.2 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.188349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3594  protein of unknown function DUF404  31.21 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.760797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3021  hypothetical protein  32.33 
 
 		 487 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262026  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0308  hypothetical protein  31.94 
 
 		 488 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.660093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0231  protein of unknown function DUF404  30.86 
 
 		 501 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0467865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0763  hypothetical protein  31.83 
 
 		 469 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2550  hypothetical protein  32.61 
 
 		 478 aa  187  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0250642  normal  0.761485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3509  hypothetical protein  32.78 
 
 		 567 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3581  hypothetical protein  32.78 
 
 		 567 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3521  hypothetical protein  32.78 
 
 		 567 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0775  hypothetical protein  33.01 
 
 		 489 aa  186  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1749  protein of unknown function DUF404  32.64 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0364  hypothetical protein  32.68 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0934  protein of unknown function DUF404  32.2 
 
 		 487 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.411531  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1049  hypothetical protein  33.01 
 
 		 480 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0399  hypothetical protein  32.38 
 
 		 484 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3911  hypothetical protein  32.3 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3574  protein of unknown function DUF404  32.6 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1020  hypothetical protein  32.2 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.667144  normal  0.926165 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1060  protein of unknown function DUF404  32.04 
 
 		 494 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1882  protein of unknown function DUF404  33.17 
 
 		 518 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881831 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0964  protein of unknown function DUF404  32.04 
 
 		 494 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0374864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11431  hypothetical protein  33.01 
 
 		 480 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.638175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4767  protein of unknown function DUF404  29.6 
 
 		 476 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522972 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12439  hypothetical protein  31.03 
 
 		 551 aa  182  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.675027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3157  hypothetical protein  33.17 
 
 		 498 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263045  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1083  hypothetical protein  32.28 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2911  hypothetical protein  31.65 
 
 		 861 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.69744  normal  0.672466 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3183  protein of unknown function DUF404  31.92 
 
 		 606 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11421  hypothetical protein  32.52 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5581  protein of unknown function DUF404  31.47 
 
 		 481 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.658  normal  0.989755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>