61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6350 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6350  putative enediyne biosynthesis protein  100 
 
 
165 aa  340  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  hitchhiker  0.000308521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4082  hypothetical protein  74.5 
 
 
152 aa  238  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2696  hypothetical protein  73.2 
 
 
154 aa  222  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18359  normal  0.148918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6998  hypothetical protein  78.26 
 
 
142 aa  219  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83128  hitchhiker  0.00920561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0552  hypothetical protein  75.91 
 
 
146 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2180  hypothetical protein  64.29 
 
 
147 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0865  hypothetical protein  54.81 
 
 
141 aa  158  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0862335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0692  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.47 
 
 
136 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0599  thioesterase-like protein  41.3 
 
 
138 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3014  thioesterase superfamily protein  26.25 
 
 
604 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0528433  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  29.5 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  29.6 
 
 
2888 aa  55.1  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  30.6 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.23 
 
 
134 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.5 
 
 
155 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.06 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
136 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.01 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  27.19 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
136 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  29.85 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.09 
 
 
134 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.17 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  30.3 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.62 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 
143 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 
134 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.57 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  28.36 
 
 
150 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.82 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  25.58 
 
 
134 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.15 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.2 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.48 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
135 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.91 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.48 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.82 
 
 
153 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.41 
 
 
133 aa  42  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.41 
 
 
133 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 
138 aa  41.6  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  26.05 
 
 
134 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  25.29 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.01 
 
 
139 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.08 
 
 
135 aa  41.2  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 
146 aa  40.8  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
137 aa  40.8  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.36 
 
 
141 aa  40.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  27.69 
 
 
160 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>