53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4082 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4082  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  314  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6350  putative enediyne biosynthesis protein  74.5 
 
 		 165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  hitchhiker  0.000308521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2696  hypothetical protein  74.5 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18359  normal  0.148918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6998  hypothetical protein  74.47 
 
 		 142 aa  224  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83128  hitchhiker  0.00920561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0552  hypothetical protein  73.79 
 
 		 146 aa  222  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2180  hypothetical protein  66.18 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0692  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  52.94 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0865  hypothetical protein  48.94 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0862335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0599  thioesterase-like protein  43.26 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3014  thioesterase superfamily protein  27.7 
 
 		 604 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  35.29 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.13 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.06 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  26.77 
 
 		 2888 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1938  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.650407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  29.52 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  30.16 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.54 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  29.92 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  26.77 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  23.26 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  25.21 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.06 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.53 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 138 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.83 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  23.08 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.21 
 
 		 137 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.4 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  23.39 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 143 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>