37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2696 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2696  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  317  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18359  normal  0.148918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6998  hypothetical protein  82.14 
 
 		 142 aa  244  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83128  hitchhiker  0.00920561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0552  hypothetical protein  76.19 
 
 		 146 aa  233  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4082  hypothetical protein  74.5 
 
 		 152 aa  226  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6350  putative enediyne biosynthesis protein  73.2 
 
 		 165 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  hitchhiker  0.000308521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2180  hypothetical protein  70.29 
 
 		 147 aa  210  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0692  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  53.62 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0865  hypothetical protein  51.43 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0862335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0599  thioesterase-like protein  41.13 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1238  polyketide synthase  28.69 
 
 		 2888 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3014  thioesterase superfamily protein  24.67 
 
 		 604 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.16 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  31.34 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  33.82 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  32.09 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.78 
 
 		 127 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  29.1 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  28.15 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.6 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  23.13 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.67 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.11 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.15 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  28.12 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.83 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.91 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.91 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  25.2 
 
 		 144 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.82 
 
 		 150 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.61 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  27.61 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  25.93 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.39 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.98 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>