100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4531 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  100 
 
 		 87 aa  176  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  52.33 
 
 		 85 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  46.84 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  46.84 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  46.84 
 
 		 83 aa  91.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  50 
 
 		 85 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  46.15 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  45.57 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  46.15 
 
 		 85 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  44.19 
 
 		 85 aa  88.2  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  44.87 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  44.87 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  44.87 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  44.87 
 
 		 85 aa  87  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  44.16 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  43.02 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  44.87 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  42.31 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  42.31 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  42.31 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  42.31 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  42.31 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  42.31 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  42.31 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.31 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  41.03 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  41.03 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  41.03 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  41.03 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  41.03 
 
 		 84 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  45.07 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  42.31 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  42.31 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  38.46 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  41.03 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  43.66 
 
 		 96 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  41.03 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  41.03 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  39.53 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  41.03 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  43.24 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  41.03 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  39.53 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  41.03 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  43.24 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  39.74 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  35.21 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  37.18 
 
 		 82 aa  62  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  41.43 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  36.62 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  38.57 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  47.62 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  41.43 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  35.06 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  38.24 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  38.24 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  34.94 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  40 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  32.88 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  34.25 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  30 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2704  toluene-tolerance protein, putative  41.86 
 
 		 52 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  30.12 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  35.06 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  32.88 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  32.1 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  32.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  30.38 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  30.38 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  32.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  32.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  30.38 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  31.51 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  32.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  26.39 
 
 		 85 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  32.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  32.88 
 
 		 79 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  31.43 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  31.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  31.51 
 
 		 79 aa  40.8  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  29.11 
 
 		 98 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  27.14 
 
 		 82 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  27.14 
 
 		 82 aa  40  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>