138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0881 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  100 
 
 		 79 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  86.08 
 
 		 79 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  86.08 
 
 		 79 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  84.81 
 
 		 79 aa  141  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  83.54 
 
 		 79 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  83.54 
 
 		 79 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  83.54 
 
 		 79 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  83.54 
 
 		 79 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  82.28 
 
 		 79 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  81.01 
 
 		 79 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  68.35 
 
 		 79 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  53.52 
 
 		 78 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  48 
 
 		 84 aa  83.6  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  42.11 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  44 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  42.67 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  38.96 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  39.74 
 
 		 80 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  41.33 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  39.47 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  36.84 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  36.84 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.84 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  36.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  36.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0506  BolA family protein  35.82 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  36.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  36.84 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  36.84 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  36.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  36.84 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  35.53 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  38.67 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  36 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  38.16 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  34.67 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  31.17 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  38.16 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  33.77 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  32.47 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  34.67 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  34.67 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  34.67 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  34.67 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  36.07 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  36.07 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  34.67 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  37.33 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  33.33 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  33.78 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  27.85 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  28.95 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  28.95 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  30.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  26.67 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  30.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  30.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  30.67 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  32 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  32 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  32 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  32 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  29.58 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  33.33 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  28.95 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  32 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  30.67 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  32 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  30.67 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  27.85 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  29.33 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  29.11 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  29.49 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  27.85 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  32.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  29.33 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  29.33 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  36 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  31.51 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  33.8 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  33.8 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  37.14 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  33.8 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  32.05 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  32.39 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  35.21 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  33.8 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>