225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4355 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  100 
 
 
84 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  92.86 
 
 
84 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  91.67 
 
 
87 aa  163  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  91.67 
 
 
84 aa  163  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  90.48 
 
 
84 aa  161  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  86.9 
 
 
84 aa  159  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  86.9 
 
 
84 aa  157  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  83.33 
 
 
84 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  83.33 
 
 
84 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  83.33 
 
 
84 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  83.33 
 
 
84 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  83.33 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  83.33 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  83.33 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  83.33 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  83.33 
 
 
89 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  84.52 
 
 
84 aa  150  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  80.95 
 
 
84 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  80.95 
 
 
84 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  80.95 
 
 
84 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  80.95 
 
 
84 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  80.95 
 
 
84 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  64.29 
 
 
85 aa  117  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  64.47 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  56.63 
 
 
83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  55.42 
 
 
83 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  55.42 
 
 
83 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  55.42 
 
 
83 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  52.44 
 
 
85 aa  107  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  59.26 
 
 
84 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  58.02 
 
 
84 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  58.54 
 
 
85 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  53.66 
 
 
83 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  51.22 
 
 
83 aa  103  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  48.78 
 
 
83 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  54.32 
 
 
84 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  51.22 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  51.22 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  51.22 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  51.22 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  51.22 
 
 
85 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  47.56 
 
 
83 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  59.49 
 
 
82 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  51.22 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  51.22 
 
 
83 aa  94  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  51.43 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  51.43 
 
 
96 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  41.03 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  43.04 
 
 
81 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  39.47 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  40.26 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  42.67 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  42.67 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  40.26 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  41.33 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  44.64 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  50 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  44.78 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  38.67 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  39.51 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  33.33 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  33.33 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  36 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  36 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  32 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  32 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  36 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  36.36 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  36 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  36 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  36 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  36 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  36 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  36.99 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  34.67 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  38.03 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  32 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  43.64 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  32 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  34.67 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  34.67 
 
 
79 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  41.94 
 
 
99 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  31.25 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  41.94 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
92 aa  54.3  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  35.44 
 
 
85 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  40.62 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  40.62 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  40.62 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  42.59 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  42.59 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  42.59 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  44.64 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  40.62 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  33.77 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  36.36 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  40.62 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  41.27 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>