More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3251 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  100 
 
 
81 aa  170  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  96.2 
 
 
82 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  88.46 
 
 
80 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  89.61 
 
 
78 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  83.54 
 
 
79 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  85.71 
 
 
78 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  84.42 
 
 
79 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  83.12 
 
 
79 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  83.12 
 
 
79 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  83.12 
 
 
79 aa  136  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  83.12 
 
 
79 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  83.12 
 
 
79 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  83.12 
 
 
79 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  83.12 
 
 
79 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  81.82 
 
 
79 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  79.22 
 
 
79 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  71.05 
 
 
82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  73.42 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  68.42 
 
 
79 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  69.74 
 
 
82 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  64.94 
 
 
81 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  71.83 
 
 
92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  62.5 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  62.5 
 
 
82 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  66.22 
 
 
85 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  65.79 
 
 
80 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  63.16 
 
 
82 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  60 
 
 
88 aa  102  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  57.14 
 
 
80 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  60.81 
 
 
83 aa  98.6  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  58.23 
 
 
82 aa  97.1  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  52.63 
 
 
83 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  54.67 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  55.56 
 
 
80 aa  83.6  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  51.35 
 
 
85 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  54.55 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  54.55 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  47.37 
 
 
80 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  47.19 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  48.75 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  49.3 
 
 
76 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  52.11 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  47.44 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  39.24 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  39.24 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  44.3 
 
 
85 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  45.95 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  46.48 
 
 
75 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  48.61 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  42.5 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  47.37 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  45.45 
 
 
88 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  45.07 
 
 
75 aa  60.5  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2203  BolA family protein  36.67 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  42.86 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  46.27 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  42.86 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  41.43 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  38.96 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0640  BolA-like protein  45.21 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  41.43 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  39.47 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  39.47 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  43.06 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  56.14 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  36.36 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  43.84 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  42.86 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  40.74 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  39.73 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  39.47 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  43.48 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  39.24 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  38.36 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  46.03 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  40.32 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  45.9 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  40 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  43.06 
 
 
80 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  40.32 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  47.37 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  43.28 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  39.74 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  38.16 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  43.28 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  39.06 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  41.67 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  47.37 
 
 
98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  39.73 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  38.16 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  38.89 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  41.51 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>