227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3171 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  100 
 
 		 80 aa  163  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  55.41 
 
 		 78 aa  86.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  50.67 
 
 		 84 aa  84.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  41.03 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  44 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  44 
 
 		 83 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  42.5 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  44 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  42.31 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  42.31 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  40.79 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  42.31 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  42.31 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  42.31 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  42.31 
 
 		 79 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  39.74 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  41.89 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  40.54 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  41.03 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  39.74 
 
 		 79 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  37.97 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  36.25 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  38.16 
 
 		 82 aa  66.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.71 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  39.19 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  39.19 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  36.71 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  46.15 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  39.74 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  39.74 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  36.71 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  34.67 
 
 		 85 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  39.19 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  39.19 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  39.19 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  37.5 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  37.5 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  38.16 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  36.84 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  36.71 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  42.67 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  34.18 
 
 		 83 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  36.71 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  39.19 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  39.19 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  39.19 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  39.19 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  36.71 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  42.67 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  36.71 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  35.53 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  32.91 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  39.19 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  40.28 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  44.78 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  40 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  35.44 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  41.43 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  38.89 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  37.33 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  36 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  42.67 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  34.18 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  42.67 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  40.28 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  38.89 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  38.89 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  38.89 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  38.89 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  38.89 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  38.89 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  34.18 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  35.44 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  36 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  40 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  37.5 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  43.64 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  37.5 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  32.91 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  36 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  36 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  41.82 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  36 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  37.33 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  30.38 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>