139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3604 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  100 
 
 		 83 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  78.31 
 
 		 83 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  90.28 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  88.89 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  75.9 
 
 		 85 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  75.9 
 
 		 85 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  75.9 
 
 		 85 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  75.9 
 
 		 85 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  75.9 
 
 		 85 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  73.17 
 
 		 83 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  71.08 
 
 		 83 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  71.08 
 
 		 85 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  71.95 
 
 		 83 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  71.95 
 
 		 83 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  71.95 
 
 		 83 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  71.08 
 
 		 83 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  53.66 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  53.66 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  53.66 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  53.66 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  53.66 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  53.66 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  53.66 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  53.66 
 
 		 84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  53.66 
 
 		 84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  53.66 
 
 		 84 aa  110  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  51.22 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  53.66 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  51.9 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  51.9 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  47.56 
 
 		 84 aa  98.2  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  48.1 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  47.56 
 
 		 84 aa  97.8  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  53.01 
 
 		 85 aa  97.1  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  46.34 
 
 		 84 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  45.12 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  45.12 
 
 		 84 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  45.12 
 
 		 87 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  50.6 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  49.37 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  49.4 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  46.34 
 
 		 84 aa  90.9  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  50 
 
 		 85 aa  87  9e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  39.53 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  41.98 
 
 		 82 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  33.33 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  35.53 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  36 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  40 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  30.38 
 
 		 80 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  31.65 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  32.47 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  26.67 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  27.85 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  35.09 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  26.67 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  34.67 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  29.49 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  33.87 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  34.67 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  31.58 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  37.31 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  33.33 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  29.33 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  37.33 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  29.33 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  32 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  32.05 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  31.17 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  23.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  31.87 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  23.75 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  34.67 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  27.63 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  35.82 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  33.77 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  35.94 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  33.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  29.87 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  29.33 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  29.41 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  32 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3464  BolA family protein  35.06 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  39.29 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  34.21 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  39.29 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  32 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  30.67 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  32.14 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>