More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3957 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  100 
 
 		 98 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  97.96 
 
 		 98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  97.94 
 
 		 99 aa  195  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  80.21 
 
 		 97 aa  166  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  78.72 
 
 		 95 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  76.04 
 
 		 99 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  73.96 
 
 		 97 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  75 
 
 		 102 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  67.71 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  69.79 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  53.47 
 
 		 103 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0449  BolA-like protein  51.49 
 
 		 104 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  49 
 
 		 106 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  45.1 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  45.1 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002706  cell division protein BolA  48.51 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0214945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  45.1 
 
 		 106 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  46 
 
 		 104 aa  92  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  49.49 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  45 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1694  transcriptional regulator BolA  46.08 
 
 		 118 aa  90.1  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  45.28 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0934  transcriptional regulator BolA  46.94 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.150947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3070  BolA family protein  45 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0107558  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  45.54 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  44.44 
 
 		 101 aa  87.8  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03276  hypothetical protein  47 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  45.92 
 
 		 106 aa  87.4  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2879  BolA family protein  45 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.294183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0712  bolA protein  46.6 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.375659  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  45.45 
 
 		 99 aa  86.7  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.754994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00386  regulator of penicillin binding proteins and beta lactamase transcription (morphogene)  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000327919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0511  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.01904e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3198  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000754579  hitchhiker  0.0000747363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00390  hypothetical protein  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0470  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000463176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0520  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000266564  normal  0.439753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0477  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000413477  normal  0.673316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0357  transcriptional regulator BolA  44.12 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000655602  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0710  BolA-like protein  48.51 
 
 		 105 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3174  BolA family protein  44 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  47.52 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  44 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0970  transcriptional regulator BolA  45.92 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0255275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2237  BolA family protein  46.53 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.629925  normal  0.18735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1093  transcriptional regulator BolA  42 
 
 		 104 aa  84.3  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000277187  hitchhiker  0.00000275713 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3105  BolA family protein  44.44 
 
 		 99 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1099  bolA protein  44.33 
 
 		 97 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3433  BolA family protein  45.45 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0902  transcriptional regulator BolA  43.14 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000592891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0486  transcriptional regulator BolA  42.16 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0488  transcriptional regulator BolA  42.16 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000439461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0505  transcriptional regulator BolA  42.16 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000305516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0495  transcriptional regulator BolA  42.16 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000973663  hitchhiker  0.000766926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0549  transcriptional regulator BolA  42.16 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0191216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  46.88 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  46.88 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0980  BolA-like protein  43.43 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.308718  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3622  BolA family protein  44.21 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3442  BolA family protein  43.88 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0920  BolA family protein  44.33 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3370  BolA family protein  43.88 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3567  BolA family protein  43.88 
 
 		 106 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03668  BolA protein  42.57 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0936  BolA family protein  45.88 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.526813  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  42.16 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0945  BolA family protein  41.41 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2883  BolA family protein  41.05 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.665541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  41.76 
 
 		 92 aa  65.5  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  39.22 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1880  hypothetical protein  39.22 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  46.97 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1862  transcriptional regulator BolA  44.44 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.020215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0031  BolA family protein  39.77 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0535  BolA-like protein  43.21 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291649  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  43.59 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14849  predicted protein  39.36 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  47.46 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  45.9 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  45.9 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1875  BolA family protein  41.1 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.932748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  38.67 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  46.58 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3886  BolA family protein  41.46 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.784426  normal  0.0137165 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  45.76 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1203  BolA family protein  39.51 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.704892  normal  0.962968 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11230  predicted protein  38.37 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.656124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3593  BolA family protein  37.08 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.703664  normal  0.663978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  46.67 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  43.75 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  35.48 
 
 		 84 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  46.55 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  44.3 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  39.39 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  47.37 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  50 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2687  BolA family protein  38.55 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  37.88 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>