232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0726 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  100 
 
 
85 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  100 
 
 
85 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  100 
 
 
85 aa  180  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  100 
 
 
85 aa  180  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  98.82 
 
 
85 aa  178  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  92.68 
 
 
83 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  92.68 
 
 
83 aa  165  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  92.68 
 
 
83 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  91.46 
 
 
83 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  85.54 
 
 
83 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  79.76 
 
 
85 aa  150  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  80.72 
 
 
83 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  75.9 
 
 
83 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  71.08 
 
 
83 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  75 
 
 
96 aa  124  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  73.61 
 
 
96 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  58.33 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  57.14 
 
 
85 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  56.1 
 
 
84 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  54.88 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  54.88 
 
 
89 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  54.88 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  54.88 
 
 
89 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  54.88 
 
 
89 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  54.88 
 
 
89 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  54.88 
 
 
89 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  54.88 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  54.88 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  54.88 
 
 
84 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  56.96 
 
 
84 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  54.88 
 
 
84 aa  103  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  54.43 
 
 
84 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  54.43 
 
 
84 aa  103  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  55.7 
 
 
84 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  51.22 
 
 
87 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  53.66 
 
 
84 aa  101  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  51.22 
 
 
84 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  54.22 
 
 
83 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  50 
 
 
84 aa  100  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  56.1 
 
 
84 aa  100  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  51.22 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  51.22 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  44.87 
 
 
87 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  48.68 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  46.91 
 
 
82 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  42.11 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  39.19 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  32.05 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  41.1 
 
 
103 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  39.19 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  33.78 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  42.67 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  37.33 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  31.65 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  38.16 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  32 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  34.62 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  36.99 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  36.99 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  32 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  40.35 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  32 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  32 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  39.34 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  40.26 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  40.28 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  42.19 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  31.58 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  38.6 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  32 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  37.66 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  39.73 
 
 
85 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  38.46 
 
 
85 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  38.67 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  35.71 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  33.33 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  42.31 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  40.62 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  32 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  33.33 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  38.67 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  42.31 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  33.33 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  37.66 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  30.67 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  33.33 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  38.81 
 
 
99 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1712  hypothetical protein  38.67 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  32 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  40 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  32 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  38.03 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  33.72 
 
 
103 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  32 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  29.33 
 
 
82 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  32.86 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  40.62 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>