231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002414 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  98.81 
 
 		 84 aa  174  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  78.57 
 
 		 84 aa  150  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  76.19 
 
 		 85 aa  140  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  66.67 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  66.67 
 
 		 84 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  66.67 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  66.67 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  66.67 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  66.67 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  66.67 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  64.2 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  60.49 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  58.23 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  60.49 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  59.49 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  60.49 
 
 		 87 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  57.14 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  60.49 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  59.26 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  56.96 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  55.7 
 
 		 83 aa  107  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  56.96 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  56.96 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  56.96 
 
 		 83 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  59.26 
 
 		 84 aa  106  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  54.43 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  54.43 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  54.43 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  54.43 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  54.43 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  56.96 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  58.02 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  51.9 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  51.09 
 
 		 96 aa  99  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  58.82 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  56 
 
 		 85 aa  92.8  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  49.38 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  44.44 
 
 		 85 aa  90.1  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  53.66 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  46.91 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  42.67 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  41.56 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  39.74 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  37.66 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  36.84 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  35.44 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  30.67 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  31.58 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  30.38 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  35.14 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  39.44 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  31.58 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  37.33 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  39.44 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  43.64 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  34.21 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  43.64 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  38.46 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  39.76 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  31.58 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  38.16 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  36.84 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  36.84 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  36.84 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  28.57 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  42.11 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  28.57 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  36.84 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  33.77 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  33.77 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  36.62 
 
 		 78 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  40.35 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  36.62 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  36.36 
 
 		 79 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  36.62 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  40.35 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  32.47 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  30.26 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  30.59 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  39.39 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  39.39 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  50 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  35.62 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  35.62 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  35.71 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>