More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3394 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  100 
 
 
81 aa  168  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  54.32 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  54.32 
 
 
82 aa  94.4  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  55.13 
 
 
82 aa  93.6  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  54.67 
 
 
81 aa  88.2  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  52.56 
 
 
82 aa  87.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  50 
 
 
82 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  50.65 
 
 
80 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  48.1 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  48.72 
 
 
81 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  49.35 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  53.42 
 
 
79 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  53.42 
 
 
79 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  49.37 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  53.42 
 
 
78 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  54.29 
 
 
92 aa  82  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  50.67 
 
 
80 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  52.05 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  52.05 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  50.67 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  53.42 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  50.67 
 
 
92 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  47.5 
 
 
80 aa  80.1  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  49.33 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  47.44 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  48.72 
 
 
83 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  45 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  43.04 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  43.04 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  43.04 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  43.04 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  43.04 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  45.95 
 
 
82 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  44.87 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  42.86 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  43.04 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  45.95 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  40 
 
 
87 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  40.79 
 
 
85 aa  69.3  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  40.51 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  40.51 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  38.75 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  50 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  50 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  42.68 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  39.24 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  40 
 
 
85 aa  66.6  0.0000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.71 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  36.71 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  37.97 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  46.05 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  36.71 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  46.05 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  41.03 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  36.71 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  36.71 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  36.71 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  36.71 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  39.24 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  37.33 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  34.18 
 
 
85 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  36.49 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  36.49 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  40.26 
 
 
78 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  36.49 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  36.49 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  34.18 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  35.14 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  44.74 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  36.71 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  46.67 
 
 
75 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1935  BolA family protein  44.74 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  47.37 
 
 
77 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1637  BolA-like protein  50 
 
 
77 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  43.42 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  33.78 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  33.78 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1939  BolA/YrbA family protein  44.74 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  33.78 
 
 
85 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>