222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03181 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  100 
 
 
85 aa  176  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  64.71 
 
 
85 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  59.52 
 
 
85 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  58.33 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  58.33 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  58.33 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  58.33 
 
 
85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  59.76 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  58.54 
 
 
83 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  58.54 
 
 
83 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  58.54 
 
 
83 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  52.38 
 
 
85 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  54.22 
 
 
83 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  57.32 
 
 
83 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  54.88 
 
 
84 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  51.81 
 
 
83 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  52.44 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  52.44 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  52.44 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  52.44 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  52.44 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  52.44 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  52.44 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  52.44 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  52.44 
 
 
84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  52.44 
 
 
84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  54.88 
 
 
84 aa  99.4  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  51.22 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  52.44 
 
 
84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  52.44 
 
 
84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  52.44 
 
 
84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  51.22 
 
 
84 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  50.6 
 
 
83 aa  98.6  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  50 
 
 
84 aa  97.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  53.01 
 
 
83 aa  97.1  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  48.78 
 
 
85 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  52.44 
 
 
84 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  48.19 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  52.33 
 
 
87 aa  94.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  48.15 
 
 
84 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  51.22 
 
 
84 aa  94.4  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  50 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  45.68 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  44.44 
 
 
84 aa  90.1  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  50 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  50 
 
 
96 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  48.68 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  43.42 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  46.05 
 
 
82 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  34.62 
 
 
82 aa  71.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  44 
 
 
79 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  46.67 
 
 
79 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  44 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  44 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  44 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  44 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  44 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  44 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  44 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  40.54 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  40.54 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  38.03 
 
 
78 aa  63.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  42.67 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  42.67 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  48.28 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  34.18 
 
 
80 aa  60.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  41.79 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  36.71 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  33.33 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  33.75 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  34.94 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  33.75 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  34.94 
 
 
85 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  29.33 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  31.58 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  32.53 
 
 
85 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  29.33 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  45.28 
 
 
104 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  34.38 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  41.51 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  41.51 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  41.51 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  32.39 
 
 
92 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  35.48 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  34.38 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  35.48 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  41.82 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  32.53 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3266  transcriptional regulator BolA  41.51 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0394815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  34.85 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  32.88 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  30.56 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  30.3 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  30.99 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  30.99 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  30.56 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  30.3 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  30.56 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  30.99 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  30.99 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>