215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0556 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  100 
 
 		 85 aa  176  9e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  64.71 
 
 		 85 aa  117  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  56.63 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  55.95 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  57.83 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  57.14 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  57.14 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  57.14 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  57.14 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  57.14 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  59.76 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  58.54 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  58.54 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  57.32 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  57.32 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  57.32 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  57.32 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  57.32 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  58.54 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  57.32 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  57.32 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  57.32 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  57.32 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  57.32 
 
 		 84 aa  104  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  57.32 
 
 		 89 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  58.54 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  57.32 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  57.32 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  57.32 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  57.32 
 
 		 84 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  54.88 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  54.88 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  54.88 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  54.88 
 
 		 83 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  54.88 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  51.81 
 
 		 83 aa  100  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  53.66 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  49.4 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  50.6 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  49.38 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  51.22 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  50 
 
 		 87 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  46.91 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  48.61 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  47.22 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  50 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  43.42 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  45.57 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  42.67 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  44 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  41.03 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  41.03 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  41.33 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  41.33 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  41.33 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  41.33 
 
 		 79 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  42.67 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  42.67 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  35.06 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  33.33 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  40 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  36.71 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  35.53 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  38.67 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  35.44 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  38.67 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  36.71 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  35.9 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  36 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  34.62 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  35.62 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  37.04 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  37.04 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  32.84 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  32.84 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  32.84 
 
 		 98 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  37.1 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  34.48 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  32.43 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  37.84 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  30.67 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  35.06 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  34.33 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  34.48 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  32.84 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  37.1 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  34.48 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1046  transcriptional regulator BolA  38.89 
 
 		 104 aa  48.1  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00201353  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1891  hypothetical protein  37.74 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  28 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  36.51 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  32.91 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  28 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  36.51 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3237  transcriptional regulator BolA  35.19 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00596017  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3056  transcriptional regulator BolA  35.19 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3094  transcriptional regulator BolA  35.19 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000183213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>