183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4228 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  100 
 
 		 96 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  93.75 
 
 		 96 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  86.25 
 
 		 83 aa  150  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  79.75 
 
 		 83 aa  141  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  74.03 
 
 		 83 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  71.25 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  72.73 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  72.73 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  72.73 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  73.75 
 
 		 83 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  70 
 
 		 85 aa  131  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  71.79 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  71.79 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  71.79 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  71.79 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  71.79 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  48.24 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  48.24 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  48.24 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  48.24 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  48.24 
 
 		 89 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  51.28 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  58.02 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  51.28 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  51.28 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  51.28 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  51.28 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  56.79 
 
 		 84 aa  100  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  50 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  53.57 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  48.72 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  48.72 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  48.78 
 
 		 85 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  46.67 
 
 		 84 aa  94  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  46.15 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  46.15 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  46.15 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  44.87 
 
 		 84 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  49.37 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  44.87 
 
 		 84 aa  88.6  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  48 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  45.95 
 
 		 85 aa  85.5  2e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  46.25 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  41.56 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  42.11 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  40.26 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  44.07 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  31.17 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  34.67 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  35.21 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  43.28 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  40.35 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  43.28 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  31.08 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  38.6 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  32.88 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  39.34 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  35.62 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  41.79 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  40.3 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  41.94 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  39.66 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  27.78 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  34.25 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  29.17 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  33.82 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2994  transcriptional regulator BolA  38.89 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00410783  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  29.58 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  29.58 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  35.82 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  32.43 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  32.43 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  37.74 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  37.88 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  37.74 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  39.06 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  39.06 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  39.06 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  32.47 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0745  BolA family protein  40.74 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  35.62 
 
 		 83 aa  47.4  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  33.93 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09531  BolA-like protein  34.62 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.336163 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  29.58 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0548  BolA-like protein  32.69 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.708138  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  36.62 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2063  BolA-like protein  39.62 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00668109  normal  0.394391 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1364  BolA family protein  37.5 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164868  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  40 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  29.17 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4711  BolA family protein  39.44 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1784  transcriptional regulator BolA  32.63 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  31.03 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  27.63 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  37.04 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  28.17 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>