More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0103 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  100 
 
 
79 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  92.41 
 
 
82 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  71.05 
 
 
79 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  72.37 
 
 
78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  72.37 
 
 
79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  71.05 
 
 
82 aa  124  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  69.74 
 
 
79 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  69.74 
 
 
80 aa  123  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  69.74 
 
 
79 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  69.74 
 
 
78 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  68.42 
 
 
81 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  69.74 
 
 
79 aa  120  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  60 
 
 
92 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  59.21 
 
 
82 aa  100  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  59.21 
 
 
82 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  60.53 
 
 
83 aa  100  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  54.05 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  57.33 
 
 
82 aa  96.7  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  54.93 
 
 
92 aa  94.4  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  50.65 
 
 
81 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  55.13 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  56 
 
 
80 aa  93.6  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  54.67 
 
 
80 aa  92.8  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  56 
 
 
82 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  53.33 
 
 
82 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  52.7 
 
 
85 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  51.35 
 
 
80 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  47.44 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  47.44 
 
 
110 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  42.11 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  42.11 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  49.33 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  45.95 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2203  BolA family protein  43.02 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  45.33 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  65.22 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  44 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  45.07 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  49.02 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  42.86 
 
 
88 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  42.25 
 
 
85 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  41.56 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  36.49 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  40.26 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  45.33 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  41.89 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  36.99 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  43.48 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  36.99 
 
 
78 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  41.56 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  38.36 
 
 
78 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  39.19 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0211  BolA family protein  51.79 
 
 
110 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000629362  normal  0.330407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  40.85 
 
 
76 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  42.25 
 
 
75 aa  60.1  0.000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  37.33 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  38.36 
 
 
78 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  35.14 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  42.25 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1531  putative stress-induced morphogen BolA  55.32 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0302247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  36.49 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  38.55 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0204  BolA family protein  39.13 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0507648  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  38.46 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  37.66 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  36.11 
 
 
78 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1921  BolA family protein  54.17 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.066107  normal  0.787426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2279  putative stress-induced morphogene BolA- like protein  54.17 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0932  transcriptional regulator BolA  35.71 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0202581  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1363  BolA family protein  55.32 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1934  BolA family protein  57.45 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139583  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14721  BolA-like protein  42.47 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0966227  normal  0.893759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6168  BolA-like protein  57.45 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1911  BolA family protein  57.45 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03686  BolA domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12490)  36.71 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.463836  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3118  BolA family protein  38.89 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.711146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1506  BolA family protein  39.19 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.935248  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1309  BolA-like protein  40 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  45 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5212  transcriptional regulator BolA  57.45 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  37.66 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  47.37 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2145  BolA family protein  38.96 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.230515  normal  0.346751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1185  BolA family protein  42.47 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.234576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  41.33 
 
 
85 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0836  bolA-related protein  38.96 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0828  bolA-related protein  38.96 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.775984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>