213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3580 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  100 
 
 		 89 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  100 
 
 		 89 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  100 
 
 		 89 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  100 
 
 		 89 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  100 
 
 		 89 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  100 
 
 		 84 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  100 
 
 		 84 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  97.62 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  97.62 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  97.62 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  89.29 
 
 		 84 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  84.52 
 
 		 84 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  83.33 
 
 		 84 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  82.14 
 
 		 87 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  82.14 
 
 		 84 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  82.14 
 
 		 84 aa  149  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  80.95 
 
 		 84 aa  148  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  78.57 
 
 		 84 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  78.57 
 
 		 84 aa  140  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  66.67 
 
 		 85 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  66.67 
 
 		 84 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  65.43 
 
 		 84 aa  120  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  57.83 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  54.88 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  56.63 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  56.63 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  56.63 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  53.66 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  54.88 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  53.66 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  54.88 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  54.88 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  54.88 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  54.88 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  54.88 
 
 		 85 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  56.79 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  53.66 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  57.32 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  61.33 
 
 		 85 aa  104  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  52.44 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  54.93 
 
 		 96 aa  98.6  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  53.52 
 
 		 96 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  45.12 
 
 		 83 aa  84.7  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  53.16 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  42.31 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  41.56 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  40 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  40.79 
 
 		 80 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  40.26 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  36.71 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  36.71 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  34.67 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12900  BolA-like protein  39.47 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  35.53 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  37.66 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  37.66 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  39.47 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  39.47 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  36.25 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0868  BolA-like protein  38.16 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  38.16 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  38.16 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  38.16 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  38.16 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4442  toluene tolerance protein, putative  39.47 
 
 		 79 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  32.89 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4136  BolA-like protein  39.47 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  36.84 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  31.58 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  41.43 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  32.89 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  28.57 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  28.57 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  37.18 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  30.26 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  37.84 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  36.62 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1961  BolA family protein  36.36 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.833915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  32.47 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  35.8 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1660  BolA family protein  35.37 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  34.67 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  34.18 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  36.84 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  34.72 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  36.11 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  34.72 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  34.72 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  42.11 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  34.72 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  40 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  34.12 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  40 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  33.33 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>