226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0684 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0684  BolA family protein  100 
 
 		 83 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.902117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3338  BolA family protein  100 
 
 		 83 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.709756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0683  BolA family protein  100 
 
 		 83 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3949  BolA/YrbA family protein  98.8 
 
 		 83 aa  174  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0718  BolA family protein  92.68 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0727  BolA family protein  92.68 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.143477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0726  BolA family protein  92.68 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0697  BolA family protein  92.68 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3657  BolA family protein  92.68 
 
 		 85 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00275191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0501  BolA-like protein  85.37 
 
 		 83 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000135912  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3365  BolA family protein  80.49 
 
 		 83 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3076  BolA-like protein  78.05 
 
 		 85 aa  144  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3299  BolA family protein  73.17 
 
 		 83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.76546  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3604  BolA family protein  71.95 
 
 		 83 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0738  BolA family protein  76.06 
 
 		 96 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.294859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4228  BolA family protein  74.65 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0286445  hitchhiker  0.000207136 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3626  BolA family protein  57.83 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00172432  normal  0.251459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03055  predicted DNA-binding transcriptional regulator  56.63 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0198395  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0517  BolA family protein  56.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000427733  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03006  hypothetical protein  56.63 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0149575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4512  BolA/YrbA family protein  56.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00331661  normal  0.461859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3580  BolA/YrbA family protein  56.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0837245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0510  BolA family protein  56.63 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983547  normal  0.100311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3486  BolA/YrbA family protein  56.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.142605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3676  BolA/YrbA family protein  56.63 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000542311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3569  hypothetical protein  56.63 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.659665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3605  hypothetical protein  56.63 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.222398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3498  protein YrbA  56.63 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00460325  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3667  hypothetical protein  56.63 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16024  normal  0.0806875 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3500  protein YrbA  56.63 
 
 		 84 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3645  BolA family protein  57.83 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3803  BolA family protein  59.49 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00264294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  56.63 
 
 		 84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4355  BolA family protein  55.42 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.262326  normal  0.0122261 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002414  protein yrbA  56.96 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  56.96 
 
 		 84 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03181  BolA-like protein  58.54 
 
 		 85 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0517  BolA family protein  54.22 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.084778  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0453  putative BolA protein  54.22 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.058957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1141  morphology/transcription regulator BolA family protein  53.01 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2097  BolA family protein  56.96 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0556  BolA-like protein  54.88 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.056636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0510  hypothetical protein  51.81 
 
 		 85 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0293  BolA family protein  55.42 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1168  morphology/transcription regulator BolA family protein  53.66 
 
 		 83 aa  99.8  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.512762  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4531  BolA/YrbA family protein  46.84 
 
 		 87 aa  91.7  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0027  BolA/YrbA family protein  53.95 
 
 		 85 aa  89.7  1e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2882  BolA family protein  48.15 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.102298  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  42.11 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  39.19 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  32.05 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  36.49 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2409  BolA family protein  36.36 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129014  normal  0.132469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  41.1 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  36 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  43.06 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2172  BolA-like protein  42.67 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1765  BolA-like protein  38.1 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.082138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  33.33 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  33.33 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0908  hypothetical protein  36.99 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0877  hypothetical protein  36.99 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53190  morphogene protein BolA  41.43 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1733  bolA protein  42.19 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.79487  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3659  BolA-like protein  43.28 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.343576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  41.94 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0500  BolA family protein  39.34 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  30.67 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  40.35 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  31.58 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  29.11 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0963  BolA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1002  BolA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0970  BolA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4252  BolA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  32 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  32 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  38.18 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  32.05 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  38.6 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0893  BolA family protein  37.66 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0866848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  42.31 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1117  BolA-like protein  38.67 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  34.18 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  42.31 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34860  BolA-like protein  41.94 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  35.82 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4662  morphogene protein BolA  39.39 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  45.1 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0881  BolA family protein  30.67 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.066697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1757  BolA family protein  40.62 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0775498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1348  BolA family protein  40.62 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.686436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3957  BolA family protein  40.62 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533041  normal  0.0136089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57820  hypothetical protein  30.67 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5023  hypothetical protein  30.67 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  37.33 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  30.67 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  40.54 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  40.54 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1391  BolA family protein  36.36 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45441  normal  0.295987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>