More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0340 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0349  BolA family protein  100 
 
 
79 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802169  normal  0.312318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3520  BolA-like protein  100 
 
 
79 aa  166  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0401  BolA family protein  100 
 
 
79 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2685  BolA-like protein  100 
 
 
79 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0340  BolA family protein  100 
 
 
79 aa  166  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0422  BolA family protein  100 
 
 
79 aa  166  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0325  BolA family protein  98.73 
 
 
79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2768  BolA/YrbA family protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2717  BolA/YrbA family protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3669  BolA/YrbA family protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1785  BolA/YrbA family protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3696  BolA-like protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2996  BolA/YrbA family protein-related protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3236  BolA/YrbA family protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3727  BolA/YrbA family protein  94.94 
 
 
79 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0395  putative morphogene protein, BolA  92.41 
 
 
79 aa  157  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3563  BolA family protein  91.14 
 
 
79 aa  153  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.480787  hitchhiker  0.0000372563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2762  BolA family protein  86.08 
 
 
79 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3232  BolA family protein  87.18 
 
 
80 aa  143  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2954  hypothetical protein  87.01 
 
 
78 aa  142  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2885  BolA family protein  88.31 
 
 
78 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3114  BolA-like protein  85.71 
 
 
82 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3251  BolA-like protein  83.12 
 
 
81 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0104  BolA family protein  75 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0103  BolA family protein  71.05 
 
 
79 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0570804  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0828  BolA family transcriptional regulator  70.27 
 
 
92 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.997437  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1584  BolA family protein  71.83 
 
 
92 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0325559 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0724  BolA family protein  63.64 
 
 
82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0757  BolA family protein  63.64 
 
 
82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71581  normal  0.376056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1021  BolA family protein  67.57 
 
 
82 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.484006  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0693  BolA family protein  64.86 
 
 
81 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.804034  normal  0.739006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5528  BolA family protein  64.86 
 
 
82 aa  100  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750325  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0801  BolA-like protein  63.51 
 
 
85 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4454  BolA family protein  62.16 
 
 
82 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0412655  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1892  hypothetical protein  60.27 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1162  BolA family protein  63.51 
 
 
80 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0244  BolA-like protein  63.51 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.447215  normal  0.0978387 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2742  BolA-like protein  57.89 
 
 
83 aa  93.6  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2943  BolA-like protein  55.41 
 
 
80 aa  92  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.257379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3394  BolA-like protein  52.05 
 
 
81 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1644  bolA protein  50.6 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.448152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0896  BolA family protein  51.35 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.112383  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0355  BolA family protein  52.78 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0345448  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2646  BolA family protein  53.25 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3037  BolA family protein  53.25 
 
 
110 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1481  BolA  44.3 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.491257  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0696  BolA family protein  44.3 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00104448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0960  BolA family protein  50.7 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.279652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2690  BolA family protein  46.67 
 
 
80 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0762  hypothetical protein  47.89 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02233  BolA superfamily transcriptional regulator  50.7 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0676  BolA family protein  47.89 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2218  BolA family protein  47.22 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4729  BolA family protein  44.3 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147274  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0678  BolA-like protein  46.15 
 
 
85 aa  67  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.010477 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1146  hypothetical protein  45.57 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0590  BolA-like protein  46.15 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2115  BolA family protein  41.89 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1023  BolA family protein  40.79 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15015  normal  0.871114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2585  BolA family protein  48.15 
 
 
78 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.6655  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0006  BolA family protein  50 
 
 
78 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3598  BolA family protein  50 
 
 
88 aa  60.8  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00692216  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3171  toluene-tolerance protein, putative  38.89 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.645971  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0260  toluene-tolerance protein, putative  36.49 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4089  BolA family protein  43.66 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0263  BolA family protein  44.44 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0466064  normal  0.451976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2215  BolA-like protein  35.53 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2224  BolA family protein  43.75 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0013  BolA family protein  40.28 
 
 
78 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0874253  normal  0.885333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0012  BolA family protein  40.28 
 
 
78 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1905  hypothetical protein  45.61 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000031102  normal  0.0113289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2781  BolA-like protein  41.43 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2520  BolA-like protein  50 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269004  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2783  BolA family protein  44.59 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2195  BolA-like protein  45.61 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.083862  decreased coverage  0.00880856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00875  morphogene BolA protein  39.08 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0124  BolA family protein  49.06 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29161  predicted protein  55.32 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5266  BolA family protein  41.03 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2545  putative cell division protein BolA  45.21 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.754994 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0186  BolA family protein  38.16 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.49621  normal  0.367892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0009  BolA family protein  44.44 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03653  hypothetical protein  36.62 
 
 
84 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2203  BolA family protein  47.17 
 
 
107 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.727239  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3378  BolA family protein  45.76 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0948  BolA protein  34.15 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2733  BolA family protein  45.76 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.713853  hitchhiker  0.00000272447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1311  transcriptional regulator BolA  44.83 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.662079  normal  0.161621 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1715  BolA family protein  50.91 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.23123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1126  BolA family protein  46.3 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0011  BolA family protein  44.44 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1692  transcriptional regulator BolA  48.28 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.702172  normal  0.256803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4091  transcriptional regulator BolA  48.28 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0707  BolA-like protein  46.94 
 
 
77 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2666  BolA family protein  39.47 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.306779  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1885  bolA protein  47.17 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0166011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2528  BolA family protein  32.1 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0286  BolA family protein  38.89 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1822  BolA family protein  50 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0356  BolA-like protein  43.33 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.649032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>