More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0048 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  76.53 
 
 		 639 aa  1020    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  100 
 
 		 639 aa  1323    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0034  truncated tetracycline resistance protein  68.99 
 
 		 346 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  37.02 
 
 		 647 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  36.52 
 
 		 647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  36.52 
 
 		 647 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  36.21 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  35.69 
 
 		 647 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  35.99 
 
 		 647 aa  398  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  35.54 
 
 		 647 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  35.29 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  35.69 
 
 		 647 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  35.48 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  34.44 
 
 		 661 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 657 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  34.19 
 
 		 662 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  35.11 
 
 		 656 aa  343  5e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0035  truncated tetracycline resistance protein  68.49 
 
 		 288 aa  343  7e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.889481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  34.44 
 
 		 651 aa  343  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  34.69 
 
 		 632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  34.06 
 
 		 652 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 647 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  31.17 
 
 		 888 aa  288  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  29.9 
 
 		 880 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  28.73 
 
 		 882 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4509  elongation factor G  28.83 
 
 		 697 aa  267  5e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  27.91 
 
 		 694 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  29.66 
 
 		 885 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  27.16 
 
 		 692 aa  254  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  27 
 
 		 699 aa  253  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  29.27 
 
 		 690 aa  252  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  27.68 
 
 		 695 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.66 
 
 		 689 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0770  elongation factor G  27.68 
 
 		 695 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  28.99 
 
 		 640 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  28.06 
 
 		 691 aa  251  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3923  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.96 
 
 		 703 aa  251  4e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  30.81 
 
 		 642 aa  250  6e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.37 
 
 		 698 aa  250  6e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  26.4 
 
 		 691 aa  249  9e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.38 
 
 		 694 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  28.47 
 
 		 695 aa  249  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  28.12 
 
 		 683 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  27.43 
 
 		 691 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.01 
 
 		 692 aa  248  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.35 
 
 		 691 aa  247  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  27.04 
 
 		 692 aa  245  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0544  elongation factor G  28.17 
 
 		 694 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.372581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  28.23 
 
 		 690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  27.94 
 
 		 701 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  27.85 
 
 		 704 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  28.49 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  26.87 
 
 		 691 aa  243  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  26.17 
 
 		 700 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  28.08 
 
 		 697 aa  243  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  26.65 
 
 		 691 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  26.79 
 
 		 698 aa  242  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  26.58 
 
 		 701 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  26.67 
 
 		 693 aa  241  2e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.23 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  26.65 
 
 		 691 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  26.58 
 
 		 701 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  27.15 
 
 		 689 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  26.58 
 
 		 701 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  26.64 
 
 		 698 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  28.89 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  27.01 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  25.32 
 
 		 704 aa  241  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  28.78 
 
 		 646 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  27.26 
 
 		 691 aa  241  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  26.53 
 
 		 695 aa  241  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0464  elongation factor G  27.98 
 
 		 695 aa  241  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  27.01 
 
 		 691 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  26.68 
 
 		 689 aa  240  5e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  27.01 
 
 		 691 aa  240  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  26.53 
 
 		 695 aa  240  8e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  28.38 
 
 		 646 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  26.22 
 
 		 704 aa  239  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  26.32 
 
 		 692 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  26.12 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  26.91 
 
 		 691 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  239  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  27.72 
 
 		 701 aa  239  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.39 
 
 		 692 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  25.38 
 
 		 693 aa  238  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  26.48 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  27.16 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  25.34 
 
 		 713 aa  238  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  26.36 
 
 		 706 aa  238  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  26.84 
 
 		 700 aa  237  4e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1096  translation elongation factor G  27.7 
 
 		 709 aa  237  5.0000000000000005e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  26.08 
 
 		 692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  29.19 
 
 		 695 aa  237  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.67 
 
 		 691 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  29.19 
 
 		 695 aa  236  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>