More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8220 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  56.69 
 
 		 657 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  100 
 
 		 647 aa  1258    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  48.81 
 
 		 656 aa  505  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  41.33 
 
 		 647 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  40.63 
 
 		 647 aa  504  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  40.79 
 
 		 647 aa  505  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  40.48 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  41.03 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  40.79 
 
 		 647 aa  502  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  40.94 
 
 		 647 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  40.94 
 
 		 647 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  39.88 
 
 		 647 aa  490  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  40.79 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  46.08 
 
 		 662 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  47.17 
 
 		 632 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  44.23 
 
 		 651 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  44.58 
 
 		 652 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  43.71 
 
 		 661 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  32.55 
 
 		 639 aa  327  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  33.55 
 
 		 639 aa  323  5e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  28.21 
 
 		 640 aa  229  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  28.24 
 
 		 888 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  28.04 
 
 		 880 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  27.7 
 
 		 885 aa  225  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 882 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  28.25 
 
 		 694 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  27.86 
 
 		 692 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  25.89 
 
 		 646 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  27.14 
 
 		 697 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  25.24 
 
 		 646 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.66 
 
 		 692 aa  202  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  28.7 
 
 		 690 aa  201  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.58 
 
 		 691 aa  200  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.81 
 
 		 642 aa  200  7e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  28.55 
 
 		 690 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  28.4 
 
 		 690 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  30.29 
 
 		 678 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  28.55 
 
 		 691 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  28.55 
 
 		 691 aa  197  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  28.08 
 
 		 691 aa  196  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  29.45 
 
 		 695 aa  195  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2349  elongation factor G  27.46 
 
 		 696 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.0392364 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  26.95 
 
 		 691 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  28.3 
 
 		 695 aa  195  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  28.06 
 
 		 690 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  26.18 
 
 		 693 aa  195  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  28.42 
 
 		 691 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1356  elongation factor G  27.35 
 
 		 690 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.442943  normal  0.0310801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1738  small GTP-binding protein  28.8 
 
 		 668 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  28.08 
 
 		 690 aa  193  9e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  27.5 
 
 		 689 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  28.55 
 
 		 695 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  27.89 
 
 		 691 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  26.74 
 
 		 697 aa  192  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.4 
 
 		 698 aa  192  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  27.58 
 
 		 691 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  27.33 
 
 		 689 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  28.96 
 
 		 691 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5073  elongation factor G  27.57 
 
 		 690 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193124  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  28.19 
 
 		 698 aa  191  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1757  translation elongation factor G  30.75 
 
 		 689 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  25.26 
 
 		 692 aa  191  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  28.77 
 
 		 698 aa  190  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  27.98 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.09 
 
 		 692 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  27.03 
 
 		 700 aa  189  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  28.18 
 
 		 698 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0270  elongation factor G  27.52 
 
 		 702 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000351784  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  27.98 
 
 		 691 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  27.33 
 
 		 695 aa  189  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  27.6 
 
 		 699 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  27.6 
 
 		 699 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  26.78 
 
 		 700 aa  189  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  27.33 
 
 		 695 aa  189  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  28.06 
 
 		 683 aa  188  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  26.23 
 
 		 709 aa  187  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  27.78 
 
 		 689 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  26.8 
 
 		 697 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0357  elongation factor G  26.92 
 
 		 698 aa  187  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.931415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  27.06 
 
 		 694 aa  187  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1676  elongation factor G  28.55 
 
 		 691 aa  187  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377788  hitchhiker  0.000311159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0464  elongation factor G  26.42 
 
 		 695 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0035  truncated tetracycline resistance protein  41.67 
 
 		 288 aa  187  8e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.889481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  26.93 
 
 		 692 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  28.27 
 
 		 690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.32 
 
 		 700 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  27.38 
 
 		 702 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  27.87 
 
 		 691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  25.52 
 
 		 689 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  27.74 
 
 		 695 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  27.76 
 
 		 704 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.88 
 
 		 695 aa  186  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0306  translation elongation factor G  27.02 
 
 		 715 aa  185  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  26.83 
 
 		 691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  27.59 
 
 		 690 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  26.12 
 
 		 691 aa  185  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  27.65 
 
 		 691 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  27.86 
 
 		 688 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  26.77 
 
 		 703 aa  185  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>