More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2069 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  100 
 
 		 656 aa  1298    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  51.14 
 
 		 657 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  44.12 
 
 		 647 aa  532  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  44.12 
 
 		 647 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  44.43 
 
 		 647 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  44.58 
 
 		 647 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  44.66 
 
 		 647 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  44.43 
 
 		 647 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  43.85 
 
 		 647 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  44.66 
 
 		 647 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  49.55 
 
 		 662 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  44.05 
 
 		 647 aa  522  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  44.12 
 
 		 647 aa  520  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  48.66 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 651 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  46.17 
 
 		 652 aa  488  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  48.35 
 
 		 632 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  42.9 
 
 		 661 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  34.44 
 
 		 639 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  35.11 
 
 		 639 aa  348  1e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  32.24 
 
 		 882 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  30.91 
 
 		 885 aa  278  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  31.39 
 
 		 880 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  30.41 
 
 		 888 aa  262  2e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  29.22 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  28.74 
 
 		 691 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  28.86 
 
 		 691 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  29.22 
 
 		 694 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  26.91 
 
 		 646 aa  239  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28 
 
 		 692 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  27.5 
 
 		 700 aa  236  9e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  28.87 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  28.82 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  28.95 
 
 		 691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  27.33 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  28.87 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  27.33 
 
 		 691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  27.18 
 
 		 691 aa  234  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  28.87 
 
 		 691 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.54 
 
 		 692 aa  234  5e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  26.11 
 
 		 646 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0475  translation elongation factor G  30.53 
 
 		 691 aa  233  8.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0202186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  27.65 
 
 		 640 aa  233  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  27.77 
 
 		 691 aa  233  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  28.36 
 
 		 693 aa  232  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  27.92 
 
 		 689 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  27.87 
 
 		 693 aa  231  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  28.74 
 
 		 691 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  28.74 
 
 		 691 aa  230  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  28.32 
 
 		 691 aa  229  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.15 
 
 		 642 aa  229  9e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  28.49 
 
 		 690 aa  229  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  26.88 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  26.88 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  26.74 
 
 		 692 aa  229  2e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  28.99 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0472  elongation factor G  28.68 
 
 		 693 aa  228  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00749701  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002637  translation elongation factor G-like protein  28.24 
 
 		 696 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000382305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  28.7 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_415  translation elongation factor G  28.09 
 
 		 693 aa  227  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000373207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03369  elongation factor G  28.13 
 
 		 695 aa  226  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  26.7 
 
 		 691 aa  226  8e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  28.28 
 
 		 706 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.06 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0306  translation elongation factor G  28.67 
 
 		 715 aa  226  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00107497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1861  elongation factor G  26.89 
 
 		 709 aa  225  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000111702  hitchhiker  0.00673824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  29.1 
 
 		 751 aa  225  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  28.8 
 
 		 689 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  28.15 
 
 		 692 aa  224  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  28.68 
 
 		 691 aa  224  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  27.38 
 
 		 698 aa  224  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  28.15 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  28 
 
 		 691 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  27.35 
 
 		 691 aa  223  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  27.92 
 
 		 690 aa  223  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  27.84 
 
 		 691 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  28.18 
 
 		 689 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  28.24 
 
 		 692 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  27.84 
 
 		 689 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  27.53 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5073  elongation factor G  28.21 
 
 		 690 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193124  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  28.93 
 
 		 690 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  27.84 
 
 		 699 aa  220  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  29.32 
 
 		 704 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.25 
 
 		 692 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  28.72 
 
 		 694 aa  219  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  27.72 
 
 		 700 aa  219  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  27.7 
 
 		 699 aa  219  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  28.11 
 
 		 697 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1921  elongation factor G  27.9 
 
 		 695 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000041036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  27.9 
 
 		 698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  29.79 
 
 		 680 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0561  translation elongation factor G  27.93 
 
 		 701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432328  hitchhiker  0.000385562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  27.75 
 
 		 697 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0584  elongation factor G  28.09 
 
 		 696 aa  217  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000111749  hitchhiker  0.000972187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0930  elongation factor G  27.19 
 
 		 697 aa  217  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000763506  hitchhiker  0.00992492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  31.78 
 
 		 678 aa  217  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  27.22 
 
 		 692 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.52 
 
 		 697 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  27.19 
 
 		 691 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>