More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0475 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0475  translation elongation factor G  100 
 
 		 691 aa  1411    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0202186  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  46.38 
 
 		 691 aa  636    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.58 
 
 		 691 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  47.01 
 
 		 691 aa  628  1e-178  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  46.73 
 
 		 695 aa  627  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  46.88 
 
 		 695 aa  627  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  46.61 
 
 		 698 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  46.43 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.08 
 
 		 690 aa  622  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  47.36 
 
 		 692 aa  622  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  45.86 
 
 		 689 aa  624  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  46.06 
 
 		 692 aa  623  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  47.94 
 
 		 697 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  45.35 
 
 		 700 aa  624  1e-177  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  46.63 
 
 		 697 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  46.47 
 
 		 704 aa  620  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  46.36 
 
 		 697 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  46.32 
 
 		 698 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  46.11 
 
 		 704 aa  622  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  45.48 
 
 		 700 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  46.33 
 
 		 704 aa  619  1e-176  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  45.74 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  46.22 
 
 		 692 aa  621  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  45.74 
 
 		 699 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  45.89 
 
 		 689 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  45.85 
 
 		 692 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  46.21 
 
 		 697 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  44.96 
 
 		 704 aa  616  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  47.63 
 
 		 701 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  45.6 
 
 		 699 aa  618  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  44.77 
 
 		 692 aa  615  1e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  45.1 
 
 		 704 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2733  translation elongation factor G  45.67 
 
 		 691 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  46.19 
 
 		 701 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  47.92 
 
 		 701 aa  613  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  45.8 
 
 		 704 aa  615  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  45.69 
 
 		 697 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  46.76 
 
 		 692 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  45.19 
 
 		 701 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  45.48 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  45.19 
 
 		 701 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  45.56 
 
 		 691 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  45.19 
 
 		 701 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  45.9 
 
 		 701 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  45.2 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  47.42 
 
 		 693 aa  610  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  45.28 
 
 		 691 aa  610  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  46.42 
 
 		 702 aa  610  1e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  45.55 
 
 		 697 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  46.48 
 
 		 708 aa  611  1e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  45.44 
 
 		 706 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0303  elongation factor G  46.1 
 
 		 700 aa  611  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  45.39 
 
 		 704 aa  611  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  45.68 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  44.99 
 
 		 701 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  46.05 
 
 		 708 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  45.18 
 
 		 697 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  45.61 
 
 		 701 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3912  elongation factor G  45.35 
 
 		 715 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0314456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0834  elongation factor G  45.36 
 
 		 706 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.757744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  46.09 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  45.93 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0961  elongation factor G  45.24 
 
 		 690 aa  607  9.999999999999999e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0481  elongation factor G  44.15 
 
 		 714 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0301247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  46.32 
 
 		 699 aa  608  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  45.11 
 
 		 702 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  45.43 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  44.83 
 
 		 704 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0451  elongation factor G  44.23 
 
 		 715 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163293  unclonable  0.000000517484 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  45.76 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4752  elongation factor G  43.86 
 
 		 714 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0168923  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  43.98 
 
 		 694 aa  603  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  43.83 
 
 		 694 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  45.3 
 
 		 704 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0161  elongation factor G  44.95 
 
 		 690 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.165931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  46.34 
 
 		 689 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0484  elongation factor G  44.23 
 
 		 715 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00540157  normal  0.0564754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  45.49 
 
 		 692 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  44.48 
 
 		 703 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  45.3 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0923  elongation factor G  45.7 
 
 		 705 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.345609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  45.04 
 
 		 700 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  45.15 
 
 		 691 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  45.03 
 
 		 697 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  45.05 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3223  elongation factor G  44.97 
 
 		 730 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  45.36 
 
 		 700 aa  603  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1753  elongation factor G  44.87 
 
 		 703 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.751097  normal  0.0412886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  45.36 
 
 		 706 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  44.4 
 
 		 713 aa  602  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  44.75 
 
 		 700 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  45.38 
 
 		 691 aa  602  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  45.27 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  44.75 
 
 		 700 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  44.93 
 
 		 694 aa  601  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  44.88 
 
 		 696 aa  601  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  44.75 
 
 		 700 aa  599  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  44.89 
 
 		 700 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  43.58 
 
 		 690 aa  598  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.65 
 
 		 697 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>