More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0451 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03191  elongation factor EF-2  67.36 
 
 
704 aa  1004    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000806084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0373  translation elongation factor G  67.36 
 
 
704 aa  1004    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000927424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  61.71 
 
 
692 aa  914    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0451  elongation factor G  100 
 
 
715 aa  1471    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.163293  unclonable  0.000000517484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4111  elongation factor G  77.87 
 
 
703 aa  1155    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  68.3 
 
 
698 aa  1016    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  56.86 
 
 
691 aa  821    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  64.53 
 
 
703 aa  947    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  62.69 
 
 
700 aa  897    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  61.01 
 
 
692 aa  891    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4765  translation elongation factor G  68.67 
 
 
699 aa  1017    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17337  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  61.73 
 
 
691 aa  909    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  59.38 
 
 
692 aa  855    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1236  elongation factor G  58.49 
 
 
694 aa  823    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0596578  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0228  elongation factor G  69.23 
 
 
698 aa  1021    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0623  translation elongation factor G  83.8 
 
 
701 aa  1206    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0318981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  60.87 
 
 
692 aa  890    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  60.87 
 
 
692 aa  890    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl622  elongation factor G  58.6 
 
 
689 aa  852    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  60.87 
 
 
692 aa  889    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  64.71 
 
 
704 aa  937    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  64.33 
 
 
700 aa  958    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  69.3 
 
 
694 aa  1021    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  69.15 
 
 
694 aa  1020    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4551  elongation factor G  83.38 
 
 
701 aa  1204    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0946111 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1895  elongation factor G  65.97 
 
 
708 aa  975    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365208  normal  0.667418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  65.31 
 
 
697 aa  952    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  56.94 
 
 
691 aa  819    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  64.53 
 
 
702 aa  944    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  62.57 
 
 
701 aa  912    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  65.13 
 
 
696 aa  989    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  64.71 
 
 
704 aa  937    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  64.33 
 
 
700 aa  958    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  67.46 
 
 
697 aa  1007    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5082  elongation factor G  85.06 
 
 
701 aa  1225    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000061463  normal  0.350289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  58.88 
 
 
692 aa  875    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  64.47 
 
 
700 aa  965    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5860  elongation factor G  64.15 
 
 
701 aa  931    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.176276  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  60.2 
 
 
704 aa  881    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  57.34 
 
 
691 aa  827    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  60.75 
 
 
704 aa  898    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  57.84 
 
 
691 aa  840    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  61.57 
 
 
692 aa  911    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0292  translation elongation factor G  66.2 
 
 
700 aa  970    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000300154  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  60.87 
 
 
692 aa  890    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  60.67 
 
 
696 aa  869    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  56.7 
 
 
691 aa  823    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  57.58 
 
 
694 aa  837    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  65.97 
 
 
696 aa  993    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0153  elongation factor G  58.18 
 
 
689 aa  852    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2691  elongation factor G  57.66 
 
 
692 aa  823    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  62.71 
 
 
692 aa  929    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  64.43 
 
 
704 aa  933    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  64.33 
 
 
700 aa  958    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  60.84 
 
 
697 aa  902    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  56.9 
 
 
698 aa  825    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  56.78 
 
 
690 aa  828    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  58.77 
 
 
690 aa  843    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  64.33 
 
 
700 aa  936    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0928  elongation factor G  71.75 
 
 
701 aa  1048    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.082436  hitchhiker  0.00424173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  56.07 
 
 
690 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  66.15 
 
 
697 aa  984    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  64.89 
 
 
700 aa  964    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4287  elongation factor G  60.39 
 
 
704 aa  905    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  65.31 
 
 
700 aa  967    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  63.39 
 
 
701 aa  917    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0167  elongation factor G  69.51 
 
 
698 aa  998    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000307195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  56.72 
 
 
690 aa  829    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0418  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  68.58 
 
 
706 aa  1006    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000594856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  56.36 
 
 
690 aa  818    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2185  elongation factor G  65.83 
 
 
708 aa  975    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00027976  normal  0.0114318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  64.8 
 
 
703 aa  951    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  62.99 
 
 
702 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0494  translation elongation factor G  64.29 
 
 
705 aa  973    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  57.06 
 
 
697 aa  858    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  57.72 
 
 
696 aa  827    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2821  elongation factor G  57.92 
 
 
697 aa  842    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.114421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1916  elongation factor G  65.03 
 
 
747 aa  943    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  64.75 
 
 
700 aa  960    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  56.62 
 
 
701 aa  829    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0602  translation elongation factor G  68.54 
 
 
701 aa  991    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000132615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1681  elongation factor G  59.47 
 
 
696 aa  842    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2717  elongation factor G  58.74 
 
 
688 aa  855    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2403  elongation factor G  58.88 
 
 
688 aa  855    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149937  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1645  elongation factor G  67.32 
 
 
700 aa  983    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.562984  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  55.96 
 
 
691 aa  828    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0196  elongation factor G  69.51 
 
 
698 aa  1027    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000160004  hitchhiker  0.000000014201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0191  elongation factor G  69.51 
 
 
698 aa  1027    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0652513  decreased coverage  0.000543209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0455  elongation factor G  67.46 
 
 
699 aa  967    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0145  elongation factor G  69.93 
 
 
698 aa  1030    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000355615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  64.33 
 
 
700 aa  963    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2576  elongation factor G  64.85 
 
 
703 aa  943    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.275425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08820  elongation factor G  89.65 
 
 
706 aa  1310    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.569469  normal  0.0264606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37710  elongation factor G  81.01 
 
 
702 aa  1196    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  58.68 
 
 
693 aa  852    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  56.58 
 
 
713 aa  826    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  64.75 
 
 
700 aa  960    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2528  elongation factor G  65.13 
 
 
703 aa  947    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  60.03 
 
 
692 aa  884    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0196  elongation factor G  69.51 
 
 
698 aa  1028    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00867813  hitchhiker  0.0000000723027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>