More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8889 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  100 
 
 		 632 aa  1249    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  54.44 
 
 		 662 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  48.19 
 
 		 661 aa  525  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  47.6 
 
 		 651 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  47.99 
 
 		 657 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  48.27 
 
 		 652 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  48.35 
 
 		 656 aa  498  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  40.18 
 
 		 647 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  40.39 
 
 		 647 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  40.39 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  40.6 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  40.21 
 
 		 647 aa  489  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  40.39 
 
 		 647 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  40.03 
 
 		 647 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  39.88 
 
 		 647 aa  488  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  39.97 
 
 		 647 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  39.97 
 
 		 647 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  46.58 
 
 		 647 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  34.69 
 
 		 639 aa  360  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  33.23 
 
 		 639 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  31.15 
 
 		 880 aa  277  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  30.72 
 
 		 888 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  31.04 
 
 		 882 aa  259  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  30.44 
 
 		 885 aa  259  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  27 
 
 		 646 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  29 
 
 		 640 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  28.12 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  27.42 
 
 		 691 aa  229  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  28.26 
 
 		 691 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  26.42 
 
 		 646 aa  227  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  27.92 
 
 		 691 aa  225  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  29.03 
 
 		 694 aa  223  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2307  translation elongation factor G  28.35 
 
 		 700 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  27.33 
 
 		 691 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.25 
 
 		 691 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2172  translation elongation factor G  28.43 
 
 		 698 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.063609  normal  0.792928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3446  elongation factor G  27.3 
 
 		 700 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.607272  normal  0.483871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  27.63 
 
 		 693 aa  216  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  27.57 
 
 		 702 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  27.66 
 
 		 703 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  26.5 
 
 		 692 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  27.66 
 
 		 703 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0316  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.91 
 
 		 697 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000146619  hitchhiker  0.000265017 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27 
 
 		 691 aa  214  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  26.9 
 
 		 700 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  27.72 
 
 		 691 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0276  elongation factor G  26.33 
 
 		 697 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000125345  unclonable  0.000000175981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0275  elongation factor G  27.34 
 
 		 702 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.374019  hitchhiker  0.000000209293 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  27.3 
 
 		 702 aa  212  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0270  elongation factor G  27.48 
 
 		 702 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000351784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  28.69 
 
 		 704 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  28.69 
 
 		 704 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  27.23 
 
 		 691 aa  211  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  28.69 
 
 		 704 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  28.69 
 
 		 704 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0089  translation elongation factor  28.57 
 
 		 751 aa  211  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  27.14 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  28.69 
 
 		 802 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  28.84 
 
 		 801 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  27.03 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  27.03 
 
 		 700 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  27.29 
 
 		 691 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  27.18 
 
 		 692 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  26.73 
 
 		 700 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  28.06 
 
 		 704 aa  210  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3863  elongation factor G  27.25 
 
 		 700 aa  210  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  27.43 
 
 		 691 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  27.8 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  26.77 
 
 		 700 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  26.89 
 
 		 700 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  26.82 
 
 		 697 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1679  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.82 
 
 		 642 aa  208  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  26.63 
 
 		 691 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.44 
 
 		 696 aa  206  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  26.77 
 
 		 700 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  26.45 
 
 		 695 aa  207  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  26.86 
 
 		 700 aa  206  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1261  elongation factor G  26.88 
 
 		 700 aa  206  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  26.5 
 
 		 700 aa  206  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.33 
 
 		 692 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  26.91 
 
 		 700 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.2 
 
 		 700 aa  205  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  26.96 
 
 		 700 aa  205  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  26.57 
 
 		 699 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  26.63 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  27.62 
 
 		 691 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0766  elongation factor G  27.64 
 
 		 701 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000320192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  26.69 
 
 		 695 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.28 
 
 		 698 aa  204  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>