More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2757 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  100 
 
 		 651 aa  1304    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  83.62 
 
 		 652 aa  1041    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  46.98 
 
 		 662 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  47.6 
 
 		 632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  40.22 
 
 		 647 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  46.49 
 
 		 657 aa  508  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  40.06 
 
 		 647 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  39.72 
 
 		 647 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  40.06 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  38.96 
 
 		 647 aa  505  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  39.69 
 
 		 647 aa  500  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  39.88 
 
 		 647 aa  500  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  38.92 
 
 		 647 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  44.44 
 
 		 656 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  39.08 
 
 		 647 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  39.08 
 
 		 647 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  43.05 
 
 		 661 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  44.1 
 
 		 647 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  34.44 
 
 		 639 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  33.9 
 
 		 639 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  30.34 
 
 		 888 aa  282  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1053  small GTP-binding protein  30.71 
 
 		 880 aa  264  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.902008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  29.7 
 
 		 882 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1823  small GTP-binding protein  28.14 
 
 		 885 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.624036  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  29.09 
 
 		 691 aa  238  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  28.85 
 
 		 691 aa  233  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0721  elongation factor G  27.79 
 
 		 694 aa  231  2e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.062401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28.02 
 
 		 692 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  27.26 
 
 		 700 aa  228  3e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  27.33 
 
 		 691 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  27.16 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  27.16 
 
 		 691 aa  224  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  26.95 
 
 		 697 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1042  translation elongation factor G, putative  25.08 
 
 		 646 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000207187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  31.2 
 
 		 678 aa  223  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  27.74 
 
 		 691 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  27.47 
 
 		 700 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  27.14 
 
 		 640 aa  223  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  27.77 
 
 		 700 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  26.99 
 
 		 691 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  27.76 
 
 		 689 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  27.77 
 
 		 700 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  27.74 
 
 		 691 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  27.71 
 
 		 694 aa  221  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  27.47 
 
 		 700 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  26.87 
 
 		 691 aa  220  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  29.59 
 
 		 682 aa  220  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1233  putative tetracycline resistance protein  24.92 
 
 		 646 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.139219  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  27.74 
 
 		 691 aa  220  7e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  28.15 
 
 		 696 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  27.25 
 
 		 703 aa  219  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  27.65 
 
 		 692 aa  219  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  27.93 
 
 		 691 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.11 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  27.74 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  26.72 
 
 		 697 aa  219  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  27.02 
 
 		 698 aa  219  2e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  26.61 
 
 		 690 aa  219  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  28.38 
 
 		 694 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  26.96 
 
 		 691 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  28.78 
 
 		 699 aa  218  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  28.78 
 
 		 699 aa  218  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  27.33 
 
 		 700 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  27.61 
 
 		 691 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.43 
 
 		 691 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.43 
 
 		 691 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  28.25 
 
 		 695 aa  216  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  27.21 
 
 		 704 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  27.51 
 
 		 701 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  27.18 
 
 		 700 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  27.51 
 
 		 701 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  27.51 
 
 		 701 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  27.33 
 
 		 692 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  27.73 
 
 		 702 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  27.2 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  25.75 
 
 		 691 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  27.06 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  25.56 
 
 		 692 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  27.67 
 
 		 700 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  27.01 
 
 		 692 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0449  elongation factor G  26.71 
 
 		 693 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  26.31 
 
 		 692 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  26.61 
 
 		 691 aa  215  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  26.95 
 
 		 702 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  27.79 
 
 		 704 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  27.35 
 
 		 689 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  27.79 
 
 		 802 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  27.79 
 
 		 704 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  27.79 
 
 		 704 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  27.79 
 
 		 704 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  27.79 
 
 		 704 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>