More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1361 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  48.66 
 
 		 680 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  46.72 
 
 		 692 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1904  elongation factor G  57.36 
 
 		 682 aa  764    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  61.23 
 
 		 680 aa  835    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0503  elongation factor G  74.13 
 
 		 698 aa  1008    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1092  elongation factor G  59.08 
 
 		 683 aa  778    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  100 
 
 		 682 aa  1373    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  47.7 
 
 		 706 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  46.72 
 
 		 692 aa  635  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  47.63 
 
 		 697 aa  634  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  45.95 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  46.42 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  46.42 
 
 		 691 aa  623  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  45.7 
 
 		 691 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  45.83 
 
 		 692 aa  621  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  45.55 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  45.16 
 
 		 692 aa  617  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  46.19 
 
 		 689 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  45.1 
 
 		 691 aa  617  1e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  45.55 
 
 		 691 aa  618  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  45.07 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  45.07 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  47.09 
 
 		 690 aa  612  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  44.93 
 
 		 692 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  44.94 
 
 		 691 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  44.74 
 
 		 692 aa  614  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  44.74 
 
 		 689 aa  611  1e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  45.74 
 
 		 704 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  45.13 
 
 		 704 aa  609  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  44.2 
 
 		 691 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  45.5 
 
 		 689 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  47.1 
 
 		 688 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  44.78 
 
 		 697 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  45.7 
 
 		 689 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  45.67 
 
 		 703 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  45.16 
 
 		 689 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  44.62 
 
 		 704 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  45.55 
 
 		 691 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  45.67 
 
 		 703 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  43.5 
 
 		 698 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  45.29 
 
 		 704 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  45.77 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  44.48 
 
 		 690 aa  600  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  43.54 
 
 		 691 aa  601  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  45.67 
 
 		 702 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  45.08 
 
 		 704 aa  601  1e-170  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0357  elongation factor G  44.48 
 
 		 696 aa  600  1e-170  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  46.49 
 
 		 715 aa  602  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  44.07 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  45.37 
 
 		 691 aa  598  1e-170  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0286  elongation factor G  44.43 
 
 		 704 aa  597  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00220543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  44.99 
 
 		 697 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  45.09 
 
 		 692 aa  598  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  44.99 
 
 		 697 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  44.63 
 
 		 689 aa  598  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  43.74 
 
 		 694 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  44.08 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  45.71 
 
 		 698 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  42.84 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2953  elongation factor G  44.74 
 
 		 708 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00010566  hitchhiker  0.00000914286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  44.08 
 
 		 699 aa  593  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  44.84 
 
 		 697 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  45.04 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  44.2 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  43.56 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  44.48 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  45.97 
 
 		 692 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  44.18 
 
 		 706 aa  591  1e-167  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  44.21 
 
 		 692 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  46.27 
 
 		 695 aa  590  1e-167  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  44.85 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  44.77 
 
 		 697 aa  588  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.41 
 
 		 697 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  45.21 
 
 		 700 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  44.22 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  46.36 
 
 		 691 aa  588  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3300  elongation factor G  44.41 
 
 		 723 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00108075  hitchhiker  0.00222959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  44.02 
 
 		 700 aa  585  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  45.52 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  45.07 
 
 		 700 aa  586  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  45.21 
 
 		 700 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  44.01 
 
 		 700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  44.33 
 
 		 700 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  44.26 
 
 		 699 aa  583  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  45.37 
 
 		 700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  44.36 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  44.26 
 
 		 699 aa  584  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  44.71 
 
 		 700 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  43.28 
 
 		 697 aa  584  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3798  elongation factor G  44.75 
 
 		 700 aa  580  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000136641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>