More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1092 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0503  elongation factor G  59.27 
 
 		 698 aa  779    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1904  elongation factor G  53.07 
 
 		 682 aa  695    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  56.45 
 
 		 680 aa  768    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  59.08 
 
 		 682 aa  779    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1092  elongation factor G  100 
 
 		 683 aa  1399    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  46.35 
 
 		 680 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  44.19 
 
 		 692 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  44.51 
 
 		 694 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  44.04 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  44.9 
 
 		 689 aa  600  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  44.8 
 
 		 706 aa  596  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  44.44 
 
 		 697 aa  593  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  43.02 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  43.31 
 
 		 692 aa  594  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  45.27 
 
 		 690 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  43.48 
 
 		 692 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  43.02 
 
 		 692 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  43.31 
 
 		 692 aa  585  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  42.59 
 
 		 691 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  43.43 
 
 		 691 aa  587  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  43.23 
 
 		 689 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  42.44 
 
 		 692 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  44.04 
 
 		 689 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  43.42 
 
 		 688 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  43.28 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.82 
 
 		 691 aa  581  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  43.27 
 
 		 689 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0253  elongation factor G  43.31 
 
 		 700 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000396279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  43.42 
 
 		 697 aa  576  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0317  elongation factor G  42.03 
 
 		 693 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00002423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  42.73 
 
 		 692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  42.96 
 
 		 689 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2327  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.94 
 
 		 697 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000709342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  42.82 
 
 		 689 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  42.39 
 
 		 704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  42.53 
 
 		 698 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  43.79 
 
 		 700 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0324  elongation factor G  43.79 
 
 		 700 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00564924  normal  0.0493558 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0345  elongation factor G  43.79 
 
 		 700 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  42.53 
 
 		 692 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  42.31 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  42.17 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  44.67 
 
 		 704 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  42.02 
 
 		 691 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  44.67 
 
 		 704 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  41.52 
 
 		 692 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4202  translation elongation factor G  46.5 
 
 		 685 aa  567  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  44.67 
 
 		 704 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  42.17 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  44.67 
 
 		 704 aa  565  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0793  elongation factor G  44.11 
 
 		 701 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  42.44 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2762  elongation factor G  43.64 
 
 		 700 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0608809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  42.3 
 
 		 692 aa  567  1e-160  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  43.13 
 
 		 693 aa  568  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1857  elongation factor G  41.78 
 
 		 699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00459949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3647  elongation factor G  43.21 
 
 		 700 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000646434  hitchhiker  0.000000000415866 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  41.26 
 
 		 683 aa  564  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  42.9 
 
 		 703 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0956  elongation factor G  44.72 
 
 		 801 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  42.98 
 
 		 692 aa  562  1.0000000000000001e-159  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2635  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00747031  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  42.17 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  42.17 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3749  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00154253  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3807  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3172  elongation factor G  43.82 
 
 		 701 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384126  hitchhiker  0.00453685 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3779  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00287392  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0334  elongation factor G  41.63 
 
 		 699 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.0000000000000603691  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  43.17 
 
 		 700 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  42.19 
 
 		 691 aa  562  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  44.31 
 
 		 688 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  42.79 
 
 		 692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  43.42 
 
 		 695 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  44.52 
 
 		 704 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3071  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3172  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361856  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3475  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0181695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  42.75 
 
 		 703 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  43.35 
 
 		 700 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1921  elongation factor G  43.5 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000761917  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1337  translation elongation factor G  43.72 
 
 		 700 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  41.42 
 
 		 697 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0952  elongation factor G  44.72 
 
 		 802 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  43.17 
 
 		 700 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  43.21 
 
 		 700 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  41.87 
 
 		 691 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  42.61 
 
 		 698 aa  561  1e-158  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  42.25 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  42.25 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  42.4 
 
 		 692 aa  558  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  43.04 
 
 		 702 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  42.14 
 
 		 696 aa  560  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  42.06 
 
 		 704 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  42.25 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0579  elongation factor G  43.85 
 
 		 698 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0311  elongation factor G  43.21 
 
 		 700 aa  561  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000859438  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3762  elongation factor G  42.12 
 
 		 698 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000464555  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0193  elongation factor G  42.12 
 
 		 698 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000238252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0200  elongation factor G  43.31 
 
 		 700 aa  560  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0641168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>