More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3805 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  100 
 
 		 661 aa  1286    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  48.71 
 
 		 662 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  48.49 
 
 		 632 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  37.46 
 
 		 647 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  37.05 
 
 		 647 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  36.71 
 
 		 647 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  36.86 
 
 		 647 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  36.79 
 
 		 647 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  36.91 
 
 		 647 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  36.91 
 
 		 647 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  36.4 
 
 		 647 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  43.32 
 
 		 651 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  43.69 
 
 		 656 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  36.5 
 
 		 647 aa  438  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  43.45 
 
 		 657 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  36.19 
 
 		 647 aa  432  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  44.56 
 
 		 652 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  43.71 
 
 		 647 aa  417  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  34.44 
 
 		 639 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  34.94 
 
 		 639 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  28.74 
 
 		 692 aa  270  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2021  elongation factor G  29.96 
 
 		 691 aa  265  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  28.05 
 
 		 692 aa  265  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  28.12 
 
 		 691 aa  259  8e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0324  elongation factor G  28.74 
 
 		 699 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.554345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0494  elongation factor G  28.74 
 
 		 699 aa  259  1e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00353597  hitchhiker  0.0000000139334 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  29.09 
 
 		 697 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  30.66 
 
 		 688 aa  256  7e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0321  elongation factor G  29.09 
 
 		 691 aa  254  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0832332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1424  translation elongation factor G  28.8 
 
 		 700 aa  254  4.0000000000000004e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.477133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  28.16 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  28.61 
 
 		 691 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  27.72 
 
 		 692 aa  249  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  28.47 
 
 		 691 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  30.11 
 
 		 701 aa  247  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19501  elongation factor G  28.8 
 
 		 691 aa  247  6e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16891  elongation factor G  28.61 
 
 		 691 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.900412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  28.36 
 
 		 695 aa  246  8e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  33.33 
 
 		 678 aa  246  8e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  28.47 
 
 		 691 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3926  elongation factor G  28.2 
 
 		 698 aa  246  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.955463  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  28.36 
 
 		 695 aa  246  9e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  28.96 
 
 		 694 aa  246  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1075  elongation factor G  28.65 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  27.39 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  27.39 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  27.16 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  28.03 
 
 		 689 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  28.74 
 
 		 690 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4318  elongation factor G  27.91 
 
 		 698 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0709  elongation factor G  29.6 
 
 		 706 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  28.25 
 
 		 692 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  27.79 
 
 		 692 aa  243  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  27.34 
 
 		 691 aa  243  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  27.63 
 
 		 691 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3303  elongation factor G  26.54 
 
 		 695 aa  243  7.999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553218  normal  0.0253676 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0885  elongation factor G  28.16 
 
 		 694 aa  243  9e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398473 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1658  elongation factor G  27.81 
 
 		 691 aa  243  9e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.182382  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  28.53 
 
 		 692 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16321  elongation factor G  28.76 
 
 		 691 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  26.37 
 
 		 704 aa  242  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  27.47 
 
 		 690 aa  242  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  27.25 
 
 		 692 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0475  translation elongation factor G  29.91 
 
 		 691 aa  242  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0202186  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23631  elongation factor G  28.36 
 
 		 691 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  28.53 
 
 		 702 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  28.43 
 
 		 691 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  27.63 
 
 		 700 aa  240  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  27.79 
 
 		 692 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  27.38 
 
 		 692 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1833  translation elongation factor G  26.78 
 
 		 693 aa  239  8e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf312  elongation factor G  26.12 
 
 		 697 aa  239  1e-61  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0497538  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  27.76 
 
 		 704 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  26.81 
 
 		 695 aa  239  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  30.11 
 
 		 701 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  28.35 
 
 		 692 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0246  elongation factor G  26.79 
 
 		 695 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2081  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.25 
 
 		 700 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  28.9 
 
 		 704 aa  238  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  27.83 
 
 		 697 aa  238  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  27.83 
 
 		 692 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  27.84 
 
 		 697 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  27.32 
 
 		 697 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  27.71 
 
 		 704 aa  236  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0273  elongation factor G  27.25 
 
 		 700 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823209  normal  0.369004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4324  translation elongation factor G  29 
 
 		 703 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  27.79 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5121  translation elongation factor G  29.06 
 
 		 704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  27.03 
 
 		 692 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  26.5 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1182  translation elongation factor G  26.89 
 
 		 699 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.0924393 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2622  translation elongation factor G  29.29 
 
 		 697 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000402697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0756  elongation factor G  28.23 
 
 		 704 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.332051  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  28.47 
 
 		 700 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2123  elongation factor G  28.23 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2252  elongation factor G  28.23 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1105  elongation factor G  28.23 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00766491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0548  elongation factor G  28.23 
 
 		 704 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  27.67 
 
 		 690 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  27.68 
 
 		 697 aa  234  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>