More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1738 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1738  small GTP-binding protein  100 
 
 		 668 aa  1375    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  47.01 
 
 		 680 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0503  elongation factor G  45.95 
 
 		 698 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  42.9 
 
 		 692 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1065  elongation factor G  42.03 
 
 		 692 aa  542  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0623  elongation factor G  42.9 
 
 		 692 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0450617  hitchhiker  1.2333199999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1092  elongation factor G  44 
 
 		 683 aa  536  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  42.47 
 
 		 692 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  43.95 
 
 		 682 aa  534  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1343  elongation factor G  42.6 
 
 		 692 aa  532  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  42.3 
 
 		 692 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  42.26 
 
 		 692 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  42.71 
 
 		 692 aa  528  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  41.46 
 
 		 691 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  42.15 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0419  elongation factor G  41.34 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000206577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0283  translation elongation factor G  40.75 
 
 		 691 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000288442  decreased coverage  0.000024327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  40.75 
 
 		 697 aa  520  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1617  translation elongation factor G  42.39 
 
 		 680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.109921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1904  elongation factor G  44.43 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  41.32 
 
 		 689 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2777  translation elongation factor G  42.51 
 
 		 689 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0295771  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  42.41 
 
 		 690 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  40.96 
 
 		 692 aa  512  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  41.64 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  41.7 
 
 		 691 aa  514  1e-144  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  40.66 
 
 		 691 aa  512  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  41.73 
 
 		 692 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  40.36 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0402  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  41.25 
 
 		 696 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000137892  normal  0.103929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  42.43 
 
 		 689 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1768  elongation factor G  42.24 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000685465  normal  0.842753 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0357  translation elongation factor G  40.74 
 
 		 692 aa  511  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000142734  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  40.15 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  40 
 
 		 692 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  40.48 
 
 		 691 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  40.15 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  40.15 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  40.3 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  42.19 
 
 		 691 aa  505  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  40.48 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  40.15 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  40.15 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  40.6 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  40.48 
 
 		 691 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2299  elongation factor G  40.7 
 
 		 704 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120894  decreased coverage  0.000176451 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  41.06 
 
 		 704 aa  506  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0475  elongation factor G  39.94 
 
 		 691 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  40.15 
 
 		 692 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  40.3 
 
 		 692 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  40.48 
 
 		 691 aa  505  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  41.9 
 
 		 706 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1187  translation elongation factor G  41.1 
 
 		 688 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000405339  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3146  translation elongation factor G  41.31 
 
 		 704 aa  506  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0077  elongation factor G  42.09 
 
 		 691 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0661  translation elongation factor G  40.12 
 
 		 692 aa  504  1e-141  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0156588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2375  elongation factor G  41.88 
 
 		 698 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.092172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  40.69 
 
 		 706 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0222  translation elongation factor G  41.53 
 
 		 689 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0488172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  39.85 
 
 		 692 aa  503  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  40.92 
 
 		 691 aa  503  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3022  elongation factor G  40.76 
 
 		 703 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000530326  decreased coverage  0.00189636 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  39.88 
 
 		 691 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0391  elongation factor G  40.83 
 
 		 694 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0366  elongation factor G  40.83 
 
 		 694 aa  500  1e-140  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  39.07 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2232  elongation factor G  40.7 
 
 		 704 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000162154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  40.97 
 
 		 704 aa  500  1e-140  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1854  elongation factor G  40.32 
 
 		 704 aa  500  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000767386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2261  elongation factor G  42.64 
 
 		 693 aa  501  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00174872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  41.23 
 
 		 697 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0559  translation elongation factor G  42.71 
 
 		 700 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.347154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3325  elongation factor G  41.69 
 
 		 703 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.888468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  41.02 
 
 		 697 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  40.78 
 
 		 697 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0212  elongation factor G  41.1 
 
 		 692 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232583  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  40.59 
 
 		 689 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  40.93 
 
 		 697 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  40.42 
 
 		 699 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  42.37 
 
 		 695 aa  498  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3183  elongation factor G  41.29 
 
 		 702 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0250795  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0294  elongation factor G  39.13 
 
 		 693 aa  496  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0624  translation elongation factor G  40.47 
 
 		 705 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0764  elongation factor G  40.44 
 
 		 696 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.156752  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  39.88 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  40.36 
 
 		 694 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  40.53 
 
 		 704 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0016  elongation factor G  40.98 
 
 		 691 aa  492  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4510  translation elongation factor G  41.95 
 
 		 699 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  39.97 
 
 		 700 aa  493  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  41.01 
 
 		 697 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0197  elongation factor G  42.35 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00036758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0698  elongation factor G  40.51 
 
 		 692 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000205392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2521  elongation factor G  42.08 
 
 		 688 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000125334  normal  0.212921 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2953  elongation factor G  40.32 
 
 		 708 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00010566  hitchhiker  0.00000914286 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002299  translation elongation factor G  41.27 
 
 		 699 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000315857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  38.8 
 
 		 692 aa  494  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  40.15 
 
 		 713 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  39.97 
 
 		 700 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  40.29 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>