More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0035 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0035  truncated tetracycline resistance protein  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.889481  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  68.49 
 
 		 639 aa  343  2e-93  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  67.35 
 
 		 639 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  48.15 
 
 		 647 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  47.18 
 
 		 647 aa  223  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  47.74 
 
 		 647 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  46.77 
 
 		 647 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  46.15 
 
 		 647 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  46.91 
 
 		 647 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  46.37 
 
 		 647 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  46.91 
 
 		 647 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  46.5 
 
 		 647 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  45.97 
 
 		 647 aa  215  9e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  43.73 
 
 		 657 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  44.49 
 
 		 661 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  40.08 
 
 		 656 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  46.18 
 
 		 662 aa  191  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  42.68 
 
 		 651 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  41.67 
 
 		 647 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  42.8 
 
 		 652 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  45.61 
 
 		 632 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0285  elongation factor G  35.29 
 
 		 683 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  37.64 
 
 		 693 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1141  elongation factor G  40.07 
 
 		 691 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000161111  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1769  elongation factor G  37.97 
 
 		 692 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00415674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1909  elongation factor G  37.12 
 
 		 697 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.105206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1281  elongation factor G  35.45 
 
 		 700 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  34.41 
 
 		 691 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0684  translation elongation factor G  35.07 
 
 		 700 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.864327 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0289  elongation factor G  35.96 
 
 		 698 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000225468  unclonable  2.3107599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  36.19 
 
 		 699 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1762  elongation factor G  37.22 
 
 		 693 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.286696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  38.35 
 
 		 691 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1948  elongation factor G  36.36 
 
 		 697 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2063  elongation factor G  36.6 
 
 		 680 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  37.59 
 
 		 691 aa  169  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  35.61 
 
 		 690 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3998  translation elongation factor G  34.75 
 
 		 691 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0770762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.33 
 
 		 689 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1014  elongation factor G  35.07 
 
 		 701 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.203543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0986  elongation factor G  35.07 
 
 		 701 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.798274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1931  elongation factor G  35.98 
 
 		 697 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1004  elongation factor G  35.07 
 
 		 701 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  38.02 
 
 		 692 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  36.84 
 
 		 689 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17210  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.66 
 
 		 704 aa  168  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.803551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  38.02 
 
 		 692 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.96 
 
 		 691 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1044  translation elongation factor G  36.16 
 
 		 706 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000201593  hitchhiker  0.00441639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  37.69 
 
 		 692 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2662  translation elongation factor G  34.7 
 
 		 700 aa  168  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  36.12 
 
 		 692 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0793  translation elongation factor G  37.45 
 
 		 695 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5076  elongation factor G  35.07 
 
 		 700 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.374408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1486  elongation factor G  36.33 
 
 		 695 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000303107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0107  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000647757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0103  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000410071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  37.64 
 
 		 692 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2980  elongation factor G  34.56 
 
 		 713 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1288  elongation factor G  37.97 
 
 		 692 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000556702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  37.59 
 
 		 695 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2016  elongation factor G  35.98 
 
 		 697 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2693  elongation factor G  33.82 
 
 		 704 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2649  elongation factor G  36.19 
 
 		 704 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4509  elongation factor G  35.96 
 
 		 697 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3154  elongation factor G  38.2 
 
 		 697 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000051485  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0712  elongation factor G  33.33 
 
 		 669 aa  166  5e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3467  translation elongation factor G  34.7 
 
 		 701 aa  165  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0283568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20910  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  36.43 
 
 		 702 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.357835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6617  translation elongation factor G  34.33 
 
 		 700 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29790  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  35.07 
 
 		 700 aa  165  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.527454 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0839  translation elongation factor G  34.67 
 
 		 706 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0803  elongation factor G  35.98 
 
 		 692 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.468644  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1904  elongation factor G  35.96 
 
 		 682 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1032  elongation factor G  35.64 
 
 		 688 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2068  translation elongation factor G  36.36 
 
 		 689 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000450896  normal  0.835571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  37.88 
 
 		 692 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3804  translation elongation factor G  34.33 
 
 		 701 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.587249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1562  elongation factor G  36.09 
 
 		 691 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00909597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0796  elongation factor G  35.96 
 
 		 695 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0475216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1397  elongation factor G  39.85 
 
 		 695 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3436  elongation factor G  36.7 
 
 		 697 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000032533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1537  elongation factor G  36.09 
 
 		 691 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17121  elongation factor G  35.16 
 
 		 691 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.668762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17001  elongation factor G  35.16 
 
 		 691 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1601  elongation factor G  34.84 
 
 		 691 aa  163  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1223  elongation factor G  32.82 
 
 		 697 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000218328  hitchhiker  0.000228753 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2198  elongation factor G  35.96 
 
 		 694 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000586447  hitchhiker  0.00000726448 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0770  elongation factor G  35.96 
 
 		 695 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1361  elongation factor G  35.47 
 
 		 682 aa  163  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  38.72 
 
 		 691 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2069  elongation factor G  35.98 
 
 		 692 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2958  elongation factor G  36.33 
 
 		 697 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000380689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0189  elongation factor G  36.46 
 
 		 703 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.180447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>