More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0034 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0034  truncated tetracycline resistance protein  100 
 
 		 346 aa  713    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0923  tetracycline resistance protein  71.01 
 
 		 639 aa  529  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0048  tetO  68.99 
 
 		 639 aa  526  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.333118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3033  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  30.26 
 
 		 647 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2828  tetracycline resistance protein  30.29 
 
 		 647 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3042  tetracycline resistance protein  30.29 
 
 		 647 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2763  tetracycline resistance protein  30.41 
 
 		 647 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3046  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.97 
 
 		 647 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2829  small GTP-binding protein  31.23 
 
 		 647 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328333  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3077  tetracycline resistance protein  30.7 
 
 		 647 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.306394  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2800  tetracycline resistance protein  29.86 
 
 		 647 aa  159  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3072  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.9 
 
 		 647 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3805  small GTP-binding protein  33.44 
 
 		 661 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2204  GTP-binding elongation factor protein, TetM/TetO family  28.41 
 
 		 647 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.335897  hitchhiker  0.000000000000106418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7137  small GTP-binding protein  32.55 
 
 		 657 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1755  small GTP-binding protein  30.98 
 
 		 662 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20982  normal  0.732753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8889  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 632 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2069  small GTP-binding protein  32.59 
 
 		 656 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.532976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2757  small GTP-binding protein  32.21 
 
 		 651 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.532594 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2501  small GTP-binding protein  30.06 
 
 		 652 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.381746  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8220  small GTP-binding protein  31.56 
 
 		 647 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  29.82 
 
 		 690 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  25.08 
 
 		 701 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  25.7 
 
 		 701 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1164  translation elongation factor G  27.21 
 
 		 698 aa  114  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000382661  hitchhiker  0.00000123904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  26.46 
 
 		 702 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0356  elongation factor G  26.3 
 
 		 691 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2220  small GTP-binding protein  28.57 
 
 		 882 aa  113  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0033  small GTP-binding protein  27.14 
 
 		 888 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.991842  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1905  elongation factor G  25.65 
 
 		 691 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.224995  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0453  elongation factor G  24.92 
 
 		 691 aa  112  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1442  elongation factor G  24.77 
 
 		 691 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4618  elongation factor G  27.24 
 
 		 700 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.566824  normal  0.722275 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4484  elongation factor G  27.24 
 
 		 700 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.707132  normal  0.129741 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1311  elongation factor G  25.08 
 
 		 691 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000260019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16260  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.74 
 
 		 703 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000508186  hitchhiker  0.00001782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3277  elongation factor G  26.28 
 
 		 701 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0394176  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0395  translation elongation factor G  27.08 
 
 		 695 aa  110  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.408849  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  24.04 
 
 		 691 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2120  elongation factor G  25.32 
 
 		 691 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.584312  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  25.55 
 
 		 689 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0513  elongation factor G  24.46 
 
 		 691 aa  109  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0730313  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0542  elongation factor G  24.46 
 
 		 691 aa  109  8.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0189  translation elongation factor G  25.09 
 
 		 691 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2067  elongation factor G  26.74 
 
 		 704 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000338261  normal  0.439953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  26.05 
 
 		 692 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  26.37 
 
 		 691 aa  108  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5073  elongation factor G  26.13 
 
 		 690 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.193124  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2910  translation elongation factor G  25.09 
 
 		 695 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00946616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5930  elongation factor G  25.68 
 
 		 702 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.955652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2537  elongation factor G  24.76 
 
 		 705 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0339845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2336  translation elongation and release factor (GTPase)  26.84 
 
 		 694 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0109511  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2426  elongation factor G  26.37 
 
 		 704 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137864  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0721  elongation factor G  25.56 
 
 		 694 aa  107  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.062401  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2729  elongation factor G  24.32 
 
 		 697 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.255792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1945  translation elongation factor G  27.31 
 
 		 678 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.92127  normal  0.0790932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3451  elongation factor G  26.13 
 
 		 690 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3187  elongation factor G  25.81 
 
 		 690 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1871  elongation factor G  23.72 
 
 		 696 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00956938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2215  elongation factor G  25 
 
 		 691 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1361  elongation factor G  25.81 
 
 		 690 aa  106  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.472174 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10040  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  24.47 
 
 		 700 aa  106  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000170843  decreased coverage  0.0000000000839395 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.27 
 
 		 691 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0804  elongation factor G  26.37 
 
 		 700 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.773269  normal  0.0692379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3444  elongation factor G  26.33 
 
 		 700 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000177525  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0264  elongation factor G  26.33 
 
 		 700 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0950  elongation factor G  26.43 
 
 		 691 aa  106  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000219808  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1708  elongation factor G  24.12 
 
 		 705 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0177  elongation factor G  25.48 
 
 		 704 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000263654  normal  0.56693 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  27.24 
 
 		 686 aa  105  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2159  elongation factor G  25 
 
 		 691 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2437  elongation factor G  25 
 
 		 691 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.318497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5535  elongation factor G  25.77 
 
 		 701 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.873781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1246  elongation factor G  25.84 
 
 		 690 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0189  elongation factor G  24.57 
 
 		 692 aa  105  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000566595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0459  translation elongation factor G  26.06 
 
 		 690 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1542  elongation factor G  25.81 
 
 		 690 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  27.33 
 
 		 683 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  23.72 
 
 		 697 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3670  elongation factor G  25.81 
 
 		 690 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2292  elongation factor G  25.81 
 
 		 690 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0335  elongation factor G  25.27 
 
 		 700 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000657567 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0584  translation elongation factor G  26.12 
 
 		 699 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19852  normal  0.151402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0755  elongation factor G  24.12 
 
 		 707 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3341  elongation factor G  25.17 
 
 		 699 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000527224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  24.28 
 
 		 689 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0050  elongation factor G  24.05 
 
 		 691 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0844  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  23.53 
 
 		 692 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0265516  decreased coverage  0.0000171204 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1214  translation elongation and release factor (GTPase)  24.54 
 
 		 673 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000546094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  26.1 
 
 		 694 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1351  elongation factor G  25.32 
 
 		 691 aa  103  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.289583  normal  0.0183349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2843  elongation factor G  25.18 
 
 		 700 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52933  normal  0.221266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2158  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  25.64 
 
 		 715 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.959287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0930  elongation factor G  27.07 
 
 		 692 aa  103  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  26.09 
 
 		 692 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2327  elongation factor G  24.16 
 
 		 697 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000853268  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0030  translation elongation factor (GTPase)  29.02 
 
 		 640 aa  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0246  elongation factor G  25.54 
 
 		 700 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000177676  normal  0.29158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3331  elongation factor G  27.07 
 
 		 692 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70074e-16 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1289  elongation factor G  26.81 
 
 		 695 aa  102  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000629985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>